“Najszybszy sposób obliczenia pary mądrych odległości Python” Kod odpowiedzi

Najszybszy sposób obliczenia pary mądrych odległości Python

#my_cython.pyx
import numpy as np
cimport numpy as np
import cython

cdef extern from "math.h":
    double abs(double t)

@cython.wraparound(False)
@cython.boundscheck(False)
def pairwise_distance(np.ndarray[np.double_t, ndim=1] r):
    cdef int i, j, c, size
    cdef np.ndarray[np.double_t, ndim=1] ans
    size = sum(range(1, r.shape[0]+1))
    ans = np.empty(size, dtype=r.dtype)
    c = -1
    for i in range(r.shape[0]):
        for j in range(i, r.shape[0]):
            c += 1
            ans[c] = abs(r[i] - r[j])
    return ans

# main.py
import numpy as np
import random

import pyximport; pyximport.install()
from my_cython import pairwise_distance

r = np.array([random.randrange(1, 1000) for _ in range(0, 1000)], dtype=float)

pairwise_distance(r)
Real Raccoon

Najszybszy sposób obliczenia pary mądrych odległości Python

import numpy as np
import random
import sklearn.metrics.pairwise
import scipy.spatial.distance

r = np.array([random.randrange(1, 1000) for _ in range(0, 1000)])
c = r[:, None]

def option1(r):
    dists = np.abs(r - r[:, None])

def option2(r):
    dists = scipy.spatial.distance.pdist(r, 'cityblock')

def option3(r):
    dists = sklearn.metrics.pairwise.manhattan_distances(r)

In [36]: timeit option1(r)
100 loops, best of 3: 5.31 ms per loop

In [37]: timeit option2(c)
1000 loops, best of 3: 1.84 ms per loop

In [38]: timeit option3(c)
100 loops, best of 3: 11.5 ms per loop
Real Raccoon

Odpowiedzi podobne do “Najszybszy sposób obliczenia pary mądrych odległości Python”

Pytania podobne do “Najszybszy sposób obliczenia pary mądrych odległości Python”

Więcej pokrewnych odpowiedzi na “Najszybszy sposób obliczenia pary mądrych odległości Python” w Python

Przeglądaj popularne odpowiedzi na kod według języka

Przeglądaj inne języki kodu

Shell/Bash
C#
C++
C
CSS
HTML
Java
JavaScript
Objective-C
PHP
Python
Sql
Swift
Ruby
TypeScript
Go
Kotlin
Assembly
R
VBA
Scala
Rust
Dart
Elixir
Clojure
Haskell
Matlab
Erlang
Cobol
Fortran
Scheme
Perl
Groovy
Lua
Julia
Delphi
Abap
Lisp
Prolog
Pascal
ActionScript
Basic
Solidity
PowerShell
GDScript
Excel