Jak zaimplementować dwuwymiarową funkcję K Ripleya?

Załączony obraz przedstawia szczelinę leśną z czerwoną sosną reprezentowaną przez koła i białą sosną reprezentowaną przez krzyże. Interesuje mnie ustalenie, czy istnieje pozytywny lub negatywny związek między dwoma gatunkami drzew sosny (tj. Czy rosną one na tych samych obszarach). Znam Kcrossa i Kmulti w pakiecie spatstat R. Ponieważ jednak mam 50 luk do przeanalizowania i jestem bardziej zaznajomiony z programowaniem w Pythonie niż R, chciałbym znaleźć iteracyjne podejście przy użyciu ArcGIS i Pythona. Jestem również otwarty na rozwiązania R.

Jak mogę zaimplementować dwuwymiarową funkcję K Ripleya?

Po wielu poszukiwaniach w tylnych rogach dokumentacji ESRI doszedłem do wniosku, że nie ma rozsądnego sposobu uruchomienia dwuwymiarowej funkcji K Ripleya w Arcpy / ArcGIS. Znalazłem jednak rozwiązanie przy użyciu R:

# Calculates an estimate of the cross-type L-function for a multitype point pattern.
library(maptools)
library(spatstat)
library(sp)

# Subset certain areas within a points shapefile.  In this case, features are grouped by gap number
gap = 1

# Read the shapefile
sdata = readShapePoints("C:/temp/GapPoints.shp")  #Read the shapefile
data = sdata[sdata$SITE_ID == gap,]  # segregate only those points in the given cluster

# Get the convex hull of the study area measurements
gapdata = readShapePoints("C:/temp/GapAreaPoints_merged.shp")  #Read the shapefile that is used to estimate the study area boundary
data2 = gapdata[gapdata$FinalGap == gap,]  # segregate only those points in the given cluster
whole = coordinates(data2) # get just the coords, excluding other data
win = convexhull.xy(whole) # Convex hull is used to get the study area boundary
plot(win)

# Converting to PPP
points = coordinates(data) # get just the coords, excluding other data
ppp = as.ppp(points, win) # Convert the points into the spatstat format
ppp = setmarks(ppp, data$SPECIES) # Set the marks to species type YB or EH
summary(ppp) # General info about the created ppp object
plot(ppp) # Visually check the points and bounding area

# Plot the cross type L function
# Note that the red and green lines show the effects of different edge corrections
plot(Lcross(ppp,"EH","YB"))

# Use the Lcross function to test the spatial relationship between YB and EH
L <- envelope(ppp, Lcross, nsim = 999, i = "EH", j = "YB")
plot(L)

Jest wbudowane narzędzie skrypt o nazwie Multi-Odległość przestrzenna analiza skupień (Ripleys K Function) pod statystyka przestrzenna - Wzory Analizowanie ToolSet w ArcToolbox. Możesz przeczytać kod źródłowy narzędzia, jeśli przejdziesz do jego właściwości i zlokalizujesz skrypt używany na karcie Źródło.