IPython / Jupyter Problemy z zapisaniem notatnika jako PDF

Próbowałem więc zapisać notatnik jupyter jako plik PDF, ale po prostu nie mogę dowiedzieć się, jak to zrobić. Pierwszą rzeczą, którą próbuję, jest pobranie z menu plików po prostu jako PDF, ale w rezultacie:

nbconvert failed: PDF creating failed

Następną rzeczą, którą próbuję, jest próba konwersji z wiersza polecenia w ten sposób

$ ipython nbconvert --to latex --post PDF MyNotebook.ipynb 

ale znowu powoduje to komunikat o błędzie

ImportError: No module named 'PDF'

i jeśli spróbuję

$ ipython nbconvert --to latex MyNotebook.ipynb 

to skutkuje

IPython.nbconvert.utils.pandoc.PandocMissing: Pandoc wasn't found:
Please check that pandoc is installed

jeśli spróbuję zainstalować pandoc ( pip install pandoc), to daje mi

ImportError: No module named 'ConfigParser'

i tutaj utknąłem, ponieważ po prostu nie wiem, co jeszcze zrobić. Czy ktoś ma pomysł, jak naprawić to, co jest nie tak?

Aby to działało, zainstalowałem latex, typowy latex extra i pandoc.

Z ubuntu:

sudo apt-get install texlive texlive-latex-extra pandoc

zajmuje to trochę czasu: kilka 100 Mb do pobrania. Czytałem gdzieś, że możesz użyć --no-install-recommendsdo texlive i extra, aby zredukować do dl.

Jeśli używasz komputera Mac i masz zainstalowany program Homebrew, otwórz powłokę terminala i zainstaluj pandoc, wpisując polecenie:

brew install pandoc

bądź cierpliwy, czas instalacji i kompilacji może zająć trochę czasu w przypadku wolnych połączeń internetowych lub starszych systemów.

2015-4-22: Wygląda na to, że aktualizacja IPythona oznacza, że --to pdfpowinna być używana zamiast --to latex --post PDF. Istnieje powiązany problem z Githubem .

Aby przekonwertować notatniki do formatu PDF, musisz najpierw zainstalować nbconvert.

pip install nbconvert
# OR
conda install nbconvert

Następnie, jeśli nie używasz Anacondy lub jeszcze tego nie zrobiłeś, musisz zainstalować pandoc, postępując zgodnie z instrukcjami na ich stronie internetowej lub w systemie Linux w następujący sposób:

sudo apt-get install pandoc

Następnie musisz mieć zainstalowany XeTex na swoim komputerze:

• Linux: TeX Live
• Mac: MacTex
• Windows: MikTex

Możesz teraz przejść do folderu, w którym znajduje się Twój notatnik IPython i uruchomić następujące polecenie:

jupyter nbconvert --to pdf MyNotebook.ipynb

w celu uzyskania dalszych informacji, sprawdź ten link .

Jak mówią komentarze do pytania, będziesz potrzebować pandoku i lateksu (np. TeXShop). Zainstalowałem pandoc z Homebrew, zajęło to tylko sekundę. Mając pandoc i TeXShop, mogłem generować lateks, ale nie PDF (w linii poleceń).

ipython nbconvert --to latex mynotebook.ipynb

Eksplorując plik latex (.tex) w TeXShop, błąd wynikał z braku arkuszy stylów i definicji. Po zainstalowaniu tych wszystkich (adjustbox.sty, adjcalc.sty, trimclip.sty, collectbox.sty, tc-pgf.def, ucs.sty, uni-global.def, utf8x.def, ucsencs.def) w końcu się udało praca.

Jednak wynik wygląda trochę zbyt fajnie jak na mój gust. Szkoda, że ​​drukowanie html z Safari traci kolorowanie składni. W przeciwnym razie nie wygląda to tak źle. (To wszystko na OS X).

Ten skrypt Pythona ma GUI do wybrania za pomocą eksploratora notatnika Ipython, który chcesz przekonwertować do formatu PDF. Podejście z wkhtmltopdf to jedyne podejście, które znalazłem, działa dobrze i zapewnia wysokiej jakości pliki PDF. Inne opisane tutaj podejścia są problematyczne, podświetlanie składni nie działa lub wykresy są popsute.

Musisz zainstalować wkhtmltopdf: http://wkhtmltopdf.org/downloads.html

i Nbconvert

pip install nbconvert
# OR
conda install nbconvert

Skrypt w Pythonie

# Script adapted from CloudCray
# Original Source: https://gist.github.com/CloudCray/994dd361dece0463f64a
# 2016--06-29
# This will create both an HTML and a PDF file

import subprocess
import os
from Tkinter import Tk
from tkFileDialog import askopenfilename

WKHTMLTOPDF_PATH = "C:/Program Files/wkhtmltopdf/bin/wkhtmltopdf"  # or wherever you keep it

def export_to_html(filename):
    cmd = 'ipython nbconvert --to html "{0}"'
    subprocess.call(cmd.format(filename), shell=True)
    return filename.replace(".ipynb", ".html")


def convert_to_pdf(filename):
    cmd = '"{0}" "{1}" "{2}"'.format(WKHTMLTOPDF_PATH, filename, filename.replace(".html", ".pdf"))
    subprocess.call(cmd, shell=True)
    return filename.replace(".html", ".pdf")


def export_to_pdf(filename):
    fn = export_to_html(filename)
    return convert_to_pdf(fn)

def main():
    print("Export IPython notebook to PDF")
    print("    Please select a notebook:")

    Tk().withdraw() # Starts in folder from which it is started, keep the root window from appearing 
    x = askopenfilename() # show an "Open" dialog box and return the path to the selected file
    x = str(x.split("/")[-1])

    print(x)

    if not x:
        print("No notebook selected.")
        return 0
    else:
        fn = export_to_pdf(x)
        print("File exported as:\n\t{0}".format(fn))
        return 1

main()

Używam notebooka Anaconda-Jupyter w systemie operacyjnym: Ubuntu 16.0 do programowania w języku Python.

Zainstaluj Nbconvert, Pandoc i Tex:

Otwórz terminal i zaimplementuj w nim następujące polecenia.

Zainstaluj Nbconvert: chociaż jest to część ekosystemu Jupyter, nadal zainstaluj go ponownie

$conda install nbconvert

Lub

$pip install nbconvert

Ale polecę użycie conda zamiast pip, jeśli używasz anakondy

Zainstaluj Pandoc: ponieważ Nbconvert używa Pandoc do konwersji markdown do formatów innych niż HTML. Wpisz następujące polecenie

$sudo apt-get install pandoc

Zainstaluj TeX: do konwersji do formatu PDF, nbconvert używa TeX-a. Wpisz następujące polecenie

$sudo apt-get install texlive-xetex

Po wykonaniu tych poleceń zamknij otwarte notatniki odśwież stronę główną Lub zrestartuj jądro otwartego notatnika. Teraz spróbuj pobrać notatnik w formacie PDF :)

Uwaga: aby uzyskać więcej informacji, zapoznaj się z oficjalną dokumentacją:
https://nbconvert.readthedocs.io/en/latest/install.html

Aby przekonwertować dowolny notatnik Jupyter do formatu PDF, postępuj zgodnie z poniższymi instrukcjami:

( Bądź w notatniku Jupyter ):

W systemie Mac OS :

polecenie + P -> pojawi się okno dialogowe drukowania -> zmień miejsce docelowe na PDF -> kliknij Drukuj

W systemie Windows :

Ctrl + P -> pojawi się okno dialogowe drukowania -> zmień miejsce docelowe na PDF -> kliknij Drukuj

Jeśli powyższe kroki nie generują pełnego pliku PDF notebooka Jupyter (prawdopodobnie dlatego, że Chrome czasami nie drukuje wszystkich wyników, ponieważ Jupyter wykonuje przewijanie dla dużych wyników),

Spróbuj wykonać poniższe czynności, aby usunąć automatyczne przewijanie w menu : -

Kredyty: @ ÂngeloPolotto

1. W notatniku Jupyter kliknij Komórka na górze notesu Jupyter

2. Następnie kliknij Wszystkie dane wyjściowe -> Przełącz przewijanie, aby usunąć automatyczne przewijanie.

Ten problem wystąpił zarówno w systemie Ubuntu, jak i Mac OSX. Po szalonych poszukiwaniach i próbach oba zostały rozwiązane. Wymaga to zarówno texi pandoc; oba zewnętrzne programy jumbo nie mogą zostać zainstalowane przez Pythona pip.

Mac OSX: przy użyciu MacPorts instalacja pandoc

port install pandoc

Powinno to zająć prawie godzinę (w zwykłym przypadku). Jeśli problem będzie się powtarzał, może być konieczne zainstalowanie dystrybucji MacTeX. TeXLive.

W przypadku Ubuntu: zainstaluj vanilla TeXLive z instalatora sieciowego - nie przez apt-get . Następnie zainstaluj pandoc za pomocą apt-get.

sudo apt-get install pandoc

Pełna instalacja TeXLive wymagałaby do 4,4 GB miejsca na dysku.

Aby zaoszczędzić na tym wszystkim, zalecanym sposobem korzystania z IPython / Jupyter Notebook byłoby zainstalowanie dystrybucji Anaconda Python.

Miałem też wiele problemów, aby to rozgryźć. Nie wiem, czy dostarczy dokładnie tego, czego potrzebujesz, ale pobrałem mój notebook jako plik HTML, a następnie pobrałem go w przeglądarce Chrome, a następnie wydrukowałem jako plik PDF, który zapisałem. Przechwycił cały mój kod, tekst i wykresy. To było wystarczająco dobre na to, czego potrzebowałem.

Jeśli korzystasz z wersji sagemath w chmurze, możesz po prostu przejść do lewego rogu i
wybrać Plik -> Pobierz jako -> Pdf przez LaTeX (.pdf).
Jeśli chcesz, sprawdź zrzut ekranu.

Zrzut ekranu Konwertuj ipynb na pdf

Jeśli z jakiegoś powodu to nie zadziała, możesz spróbować innego sposobu.
wybierz Plik -> Podgląd wydruku a następnie na podglądzie
kliknij prawym przyciskiem myszy -> Drukuj a następnie wybierz zapisz jako pdf.

Jako nowy członek nie mogłem po prostu dodać komentarza do posta, ale chcę dodać, że rozwiązanie oferowane przez Phillipa Schwartza zadziałało dla mnie. Miejmy nadzieję, że ludzie w podobnej sytuacji spróbują tej ścieżki wcześniej z naciskiem. Brak podziałów stron był frustrującym problemem przez dłuższy czas, więc jestem wdzięczny za powyższą dyskusję.

Jak powiedział Phillip Schwartz: „Musisz zainstalować wkhtmltopdf: [ http://wkhtmltopdf.org/downloads.html][1]

i Nbconvert "

Następnie dodajesz komórkę typu „rawNBConvert” i dodajesz:

<p style="page-break-after:always;"></p>

Wydawało się, że to załatwiło sprawę, a wygenerowany plik PDF miał podział strony w odpowiednich miejscach. Nie musisz jednak uruchamiać niestandardowego kodu, ponieważ wydaje się, że „normalna” ścieżka pobierania notatnika w formacie HTML, otwierania w przeglądarce i drukowania do formatu PDF działa po zainstalowaniu tych narzędzi.

notebook-as-pdf Zainstaluj python -m pip zainstaluj notebook-as-pdf pyppeteer-install

Użyj tego Możesz go również użyć z nbconvert:

jupyter-nbconvert --to PDF viaHTML nazwa_pliku.ipynb

co spowoduje utworzenie pliku o nazwie nazwa_pliku.pdf.

lub pip install notebook-as-pdf

utwórz plik PDF z notatnika jupyter-nbconvert-toPDFviaHTML

Odkryłem, że plik nbconvert / utils / pandoc.py zawiera błąd kodu, który spowodował błąd na moim komputerze. Kod sprawdza, czy pandoc znajduje się w ścieżce zmiennych środowiskowych. W przypadku mojej maszyny odpowiedź brzmi: nie. Jednak pandoc.exe jest!

Rozwiązaniem było dodanie „.exe” do kodu w linii 69

if __version is None:
    if not which('pandoc.exe'):
        raise PandocMissing()

To samo dotyczy „xelatex” nie jest zainstalowany. Dodaj do pliku nbconvert / exporters / pdf.py w wierszu 94

    cmd = which(command_list[0]+'.exe')

Aby przekonwertować .ipynb na pdf, twój system powinien zawierać 2 komponenty,

1. nbconvert : Jest częścią jupyter pozwala na konwersję ipynb do pdf

   pip install nbconvert
   OR 
   conda install nbconvert
   

2. XeTeX: Konwertuj ipynb do formatu .tex, a następnie konwertuj do formatu PDF.

   sudo apt-get install texlive-xetex
   

Następnie możesz użyć poniższego polecenia, aby przekonwertować na pdf,

ipython nbconvert --to pdf YOURNOTEBOOK.ipynb

Jeśli to nie zadziała, zainstaluj pandoc i spróbuj ponownie.

sudo apt-get install pandoc

Dla użytkowników Ubuntu odpowiedź można znaleźć tutaj . Cytuję również:

Najbardziej prawdopodobną przyczyną jest to, że nie zainstalowałeś odpowiednich zależności. Twój system Ubuntu musi mieć zainstalowane pakiety dotyczące konwersji plików LaTeX i XeTeX, aby zapisać twój notatnik jako PDF. Możesz je zainstalować przez:

sudo apt-get install texlive texlive-xetex texlive-generic-extra texlive-generic-recommended pandoc

Jest to również nbconvertinna zależność, która jest zwykle instalowana automatycznie za pomocą jupyter. Ale możesz go zainstalować dla pewności, mając aktywowane środowisko wirtualne:

pip install -U nbconvert

Miałem problemy z poprawnym wyświetlaniem niektórych symboli przy regularnym pobieraniu w formacie PDF . Pobrałem więc jako tex jupyter nbconvert --to latex "my notebook.ipynb", trochę poprawiłem w notatniku (na przykład w moim przypadku potrzebowałem tych wierszy dla mojego języka

\usepackage{tgpagella}
\usepackage[lithuanian,english]{babel}

), a następnie wyeksportowano do pliku PDF z rozszerzeniem latex --output-format=pdf "my notebook.tex".

Ale w końcu jednak, aby zachować te same znaki, jak widać w przeglądarce I skończyło się moje drukowanie przeglądarki Chrome: Ctrl+P Print to pdf. Dodaje niepotrzebny nagłówek i stopkę, ale wszystko inne pozostaje takie, jakie jest. Koniec z błędami przetwarzania paska postępu tqdm, koniec kodu wychodzącego ze strony i tak dalej. Proste.

W każdym systemie podstawowe kroki, aby poprawnie skonfigurować nbconvert do konwersji notebooków ipython do formatu PDF / Latex są

1. Zainstaluj nbconvert
2. Zainstaluj pandoc
3. Zainstaluj Texlive

Instalowanie nbconvert

pip install nbconvert

lub conda install nbconvert

Instalowanie pandoc

sudo apt-get install pandoc dla Ubuntu

lub sudo yum install pandocdla CentOS

dla innych odwiedź instalację pandoc

Instalowanie texlive

Możesz zainstalować zalecane pakiety lub przeprowadzić pełną instalację. W przypadku Ubuntu

sudo apt-get install texlive texlive-xetex texlive-generic-extra texlive-generic-recommended

`

Dla innych i dla pełnej instalacji texlive postępuj zgodnie z instrukcjami podanymi przy holowaniu zgodnie z twoim systemem i wyborem.

Pobrałem plik tar.gz z tug-texlive-download i postępowałem zgodnie z instrukcjami podanymi w TeX Live - Szybka instalacja . Podsumowanie instrukcji montażu:

1. Sprzątać

   rm -rf /usr/local/texlive/2019

   rm -rf ~/.texlive2019

2. Uruchom instalator

   rozpakuj plik zip

   cd /your/unpacked/directory

   perl install-tl

   Wpisz polecenie: i

3. Ustawienie ścieżki

   sudo vi /etc/bash.bashrc i włóż

   PATH=/usr/local/texlive/2019/bin/x86_64-linux:$PATH; export PATH

   MANPATH=/usr/local/texlive/2019/texmf-dist/doc/man:$MANPATH; export MANPATH

   INFOPATH=/usr/local/texlive/2019/texmf-dist/doc/info:$INFOPATH; export INFOPATH

4. Ustawianie domyślnego rozmiaru papieru

   tlmgr paper letter

Polecenia mogą się różnić w zależności od systemu, ale podstawowe kroki pozostają takie same.

Miałem ten błąd w Windows 10. Wykonałem te trzy kroki i rozwiązałem mój problem:

1. Zainstaluj nbconvert

   pip zainstaluj nbconvert

2. Zainstaluj pandoc

https://pandoc.org/installing.html

3. Zainstaluj miktex

https://miktex.org/download

Dobrze jest też zaktualizować biblioteki:

pip install jupyter --upgrade
pip install --upgrade --user nbconvert