Autokorelacja Python vs Julia

19

Próbuję przeprowadzić autokorelację za pomocą Julii i porównać ją z wynikiem Pythona. Dlaczego dają różne wyniki?

Kod Julii

using StatsBase

t = range(0, stop=10, length=10)
test_data = sin.(exp.(t.^2))

acf = StatsBase.autocor(test_data)

daje

10-element Array{Float64,1}:
  1.0                   
  0.13254954979179642   
 -0.2030283419321465    
  0.00029587850872956104
 -0.06629381497277881   
  0.031309038331589614  
 -0.16633393452504994   
 -0.08482388975165675   
  0.0006905628640697538 
 -0.1443650483145533

Kod Pythona

from statsmodels.tsa.stattools import acf
import numpy as np

t = np.linspace(0,10,10)
test_data = np.sin(np.exp(t**2))

acf_result = acf(test_data)

daje

array([ 1.        ,  0.14589844, -0.10412699,  0.07817509, -0.12916543,
       -0.03469143, -0.129255  , -0.15982435, -0.02067688, -0.14633346])
Ross Mariano
źródło
1
Wydrukuj dane testowe w obu przypadkach
Mad Physicist

Odpowiedzi:

26

To dlatego, że twój test_datajest inny:

Pyton:

array([ 0.84147098, -0.29102733,  0.96323736,  0.75441021, -0.37291918,
        0.85600145,  0.89676529, -0.34006519, -0.75811102, -0.99910501])

Julia:

[0.8414709848078965, -0.2910273263243299, 0.963237364649543, 0.7544102058854344,
 -0.3729191776326039, 0.8560014512776061, 0.9841238290665676, 0.1665709194875013,
 -0.7581110212957692, -0.9991050130774393]

Dzieje się tak, ponieważ bierzesz sinogromne liczby. Na przykład, gdy ostatnia liczba tto 10, exp(10^2)to ~ 2,7 * 10 ^ 43. W tej skali niedokładności zmiennoprzecinkowe wynoszą około 3 * 10 ^ 9. Więc jeśli nawet najmniej znaczący bit jest inny dla Pythona i Julii, sinwartość będzie daleka.

W rzeczywistości możemy sprawdzić podstawowe wartości binarne początkowej tablicy t. Na przykład różnią się trzecią ostatnią wartością:

Julia:

julia> reinterpret(Int, range(0, stop=10, length=10)[end-2])
4620443017702830535

Pyton:

>>> import struct
>>> s = struct.pack('>d', np.linspace(0,10,10)[-3])
>>> struct.unpack('>q', s)[0]
4620443017702830536

Rzeczywiście możemy zobaczyć, że nie zgadzają się dokładnie przez jedną maszynę epsilon. A jeśli użyjemy Julii, weźmy sinwartość uzyskaną przez Pythona:

julia> sin(exp(reinterpret(Float64, 4620443017702830536)^2))
-0.3400651855865199

Otrzymujemy tę samą wartość, co Python.

Jakob Nissen
źródło
9

Wystarczy rozwinąć nieco odpowiedź (dodając jako odpowiedź, ponieważ jest ona zbyt długa na komentarz). W Julii masz:

julia> t = collect(range(0, stop=10, length=10))
10-element Array{Float64,1}:
  0.0               
  1.1111111111111112
  2.2222222222222223
  3.3333333333333335
  4.444444444444445 
  5.555555555555555 
  6.666666666666667 
  7.777777777777778 
  8.88888888888889  
 10.0               

julia> t .- [10*i / 9 for i in 0:9]
10-element Array{Float64,1}:
 0.0
 0.0
 0.0
 0.0
 0.0
 0.0
 0.0
 0.0
 0.0
 0.0

podczas gdy w Pythonie:

>>> t = np.linspace(0,10,10)
>>> t - [10*i/9 for i in range(10)]
array([0.0000000e+00, 0.0000000e+00, 0.0000000e+00, 0.0000000e+00,
       0.0000000e+00, 0.0000000e+00, 0.0000000e+00, 8.8817842e-16,
       0.0000000e+00, 0.0000000e+00])

i widzisz, że ósma liczba w Pythonie jest niedokładnym przybliżeniem 70/9, podczas gdy w Julii w tym przypadku otrzymujesz sekwencję najbliższych przybliżeń 10*i/9użycia Float64.

Wydaje się, że ponieważ oryginalne sekwencje różnią się od ciebie, reszta postępuje zgodnie z komentarzem @Jakob Nissen.

Jednak rzeczy nie są takie proste. Ponieważ expfunkcje w Julii i Pythonie różnią się nieco tym, co produkują. Zobacz Python:

>>> from math import exp
>>> from mpmath import mp
>>> mp.dps = 1000
>>> float(mp.exp((20/3)**2) - exp((20/3)**2))
-1957.096392544307

podczas pobytu w Julii:

julia> setprecision(1000)
1000

julia> Float64(exp(big((20/3)^2)) - exp((20/3)^2))
2138.903607455693

julia> Float64(exp(big((20/3)^2)) - nextfloat(exp((20/3)^2)))
-1957.096392544307

(możesz sprawdzić, czy (20/3)^2to samo dotyczy Float64zarówno Julii, jak i Pythona).

Tak więc w tym przypadku expPython jest nieco dokładniejszy niż Julia. Dlatego nawet poprawianie t(co jest łatwe dzięki użyciu zrozumienia w Pythonie zamiast linspace) nie sprawi, że ACF będzie równy.

Podsumowując, to, co skomentował @Jakob Nissen dla tak dużych wartości, na wyniki będą silnie wpływać niedokładności liczbowe.

Bogumił Kamiński
źródło