Chciałbym zwolnić pakiet bez konieczności restartowania R (głównie dlatego, że restartowanie R podczas wypróbowywania różnych, pakiety powodujące konflikt stają się frustrujące, ale możliwe, że można to wykorzystać w programie do używania jednej funkcji, a następnie innej - chociaż przestrzeń nazw odwoływanie się jest prawdopodobnie lepszym pomysłem na takie zastosowanie).

?library nie pokazuje żadnych opcji, które mogłyby zwolnić pakiet.

Istnieje sugestia, że detachmożna zwolnić pakiet, ale oba następujące elementy kończą się niepowodzeniem:

detach(vegan)

Błąd w detach(vegan): nieprawidłowy nameargument

detach("vegan")

Błąd w detach("vegan"): nieprawidłowy nameargument

Jak więc rozładować paczkę?

Spróbuj tego (zobacz ?detachwięcej szczegółów):

detach("package:vegan", unload=TRUE)

Możliwe jest ładowanie wielu wersji pakietu jednocześnie (na przykład, jeśli masz wersję programistyczną i wersję stabilną w różnych bibliotekach). Aby zagwarantować odłączenie wszystkich kopii, użyj tej funkcji.

detach_package <- function(pkg, character.only = FALSE)
{
  if(!character.only)
  {
    pkg <- deparse(substitute(pkg))
  }
  search_item <- paste("package", pkg, sep = ":")
  while(search_item %in% search())
  {
    detach(search_item, unload = TRUE, character.only = TRUE)
  }
}

Wykorzystanie to na przykład

detach_package(vegan)

lub

detach_package("vegan", TRUE)

Możesz także użyć unloadNamespacepolecenia, jak w:

unloadNamespace("sqldf")

Funkcja odłącza przestrzeń nazw przed jej rozładowaniem.

Możesz odznaczyć przycisk pola wyboru w RStudio (pakiety).

Próbowałem tego, co napisał Kohske jako odpowiedź, i ponownie otrzymałem błąd, więc przeprowadziłem wyszukiwanie i znalazłem to, co zadziałało dla mnie (R 3.0.2):

require(splines) # package
detach(package:splines)

lub też

library(splines)
pkg <- "package:splines"
detach(pkg, character.only = TRUE)

Podczas przechodzenia między skryptami może być czasem konieczne rozładowanie pakietu. Oto prosta instrukcja JEŻELI, która zapobiegnie pojawianiu się ostrzeżeń, gdybyś próbował wyładować pakiet, który nie został aktualnie załadowany.

if("package:vegan" %in% search()) detach("package:vegan", unload=TRUE) 

Dołączenie tego na początku skryptu może być pomocne.

Mam nadzieję, że to sprawi, że Twój dzień!

detach(package:PackageName) działa i nie ma potrzeby używania cudzysłowów.

Możesz wypróbować wszystko, co chcesz usunąć pakiet (i wszystkie związane z nim zależności), unloadNamespace()ale ślad pamięci pozostanie. I nie, też detach("package:,packageName", unload=TRUE, force = TRUE)nie będzie działać.

Z nowej konsoli lub Session > Restart Rsprawdź pamięć za pomocą pryrpakietu:

pryr::mem_used()

# 40.6 MB   ## This will depend on which packages are loaded obviously (can also fluctuate a bit after the decimal)

Sprawdź mój sessionInfo()

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252  LC_CTYPE=English_Canada.1252    LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=English_Canada.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.6.1   pryr_0.1.4       magrittr_1.5     tools_3.6.1      Rcpp_1.0.3       stringi_1.4.3    codetools_0.2-16 stringr_1.4.0   
[9] packrat_0.5.0   

Załadujmy Seuratpakiet i sprawdźmy nowy ślad pamięci :

library(Seurat)
pryr::mem_used()

# 172 MB    ## Likely to change in the future but just to give you an idea

Użyjmy, unloadNamespace()aby usunąć wszystko:

unloadNamespace("Seurat")
unloadNamespace("ape")
unloadNamespace("cluster")
unloadNamespace("cowplot")
unloadNamespace("ROCR")
unloadNamespace("gplots")
unloadNamespace("caTools")
unloadNamespace("bitops")
unloadNamespace("fitdistrplus")
unloadNamespace("RColorBrewer")
unloadNamespace("sctransform")
unloadNamespace("future.apply")
unloadNamespace("future")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("ggrepel")
unloadNamespace("ggridges")
unloadNamespace("ggplot2")
unloadNamespace("gridExtra")
unloadNamespace("gtable")
unloadNamespace("uwot")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("reticulate")
unloadNamespace("rsvd")
unloadNamespace("survival")
unloadNamespace("Matrix")
unloadNamespace("nlme")
unloadNamespace("lmtest")
unloadNamespace("zoo")
unloadNamespace("metap")
unloadNamespace("lattice")
unloadNamespace("grid")
unloadNamespace("httr")
unloadNamespace("ica")
unloadNamespace("igraph")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("KernSmooth")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("MASS")
unloadNamespace("pbapply")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("png")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("RcppAnnoy")
unloadNamespace("tidyr")
unloadNamespace("dplyr")
unloadNamespace("tibble")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("tidyselect")
unloadNamespace("purrr")
unloadNamespace("htmlwidgets")
unloadNamespace("htmltools")
unloadNamespace("lifecycle")
unloadNamespace("pillar")
unloadNamespace("vctrs")
unloadNamespace("rlang")
unloadNamespace("Rtsne")
unloadNamespace("SDMTools")
unloadNamespace("Rdpack")
unloadNamespace("bibtex")
unloadNamespace("tsne")
unloadNamespace("backports")
unloadNamespace("R6")
unloadNamespace("lazyeval")
unloadNamespace("scales")
unloadNamespace("munsell")
unloadNamespace("colorspace")
unloadNamespace("npsurv")
unloadNamespace("compiler")
unloadNamespace("digest")
unloadNamespace("R.utils")
unloadNamespace("pkgconfig")
unloadNamespace("gbRd")
unloadNamespace("parallel")
unloadNamespace("gdata")
unloadNamespace("listenv")
unloadNamespace("crayon")
unloadNamespace("splines")
unloadNamespace("zeallot")
unloadNamespace("reshape")
unloadNamespace("glue")
unloadNamespace("lsei")
unloadNamespace("RcppParallel")
unloadNamespace("data.table")
unloadNamespace("viridisLite")
unloadNamespace("globals")

Teraz sprawdź sessionInfo():

R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)

Matrix products: default

locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252  LC_CTYPE=English_Canada.1252    LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C                   
[5] LC_TIME=English_Canada.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] tools_3.6.1       stringr_1.4.0     rstudioapi_0.10   pryr_0.1.4        jsonlite_1.6      gtools_3.8.1      R.oo_1.22.0      
 [8] magrittr_1.5      Rcpp_1.0.3        R.methodsS3_1.7.1 stringi_1.4.3     plyr_1.8.4        reshape2_1.4.3    codetools_0.2-16 
[15] packrat_0.5.0     assertthat_0.2.1 

Sprawdź powierzchnię pamięci :

pryr::mem_used()

# 173 MB

Link do pokazu obsady ekranu

Chciałbym dodać alternatywne rozwiązanie. To rozwiązanie nie odpowiada bezpośrednio na twoje pytanie dotyczące rozładowania pakietu, ale IMHO stanowi czystszą alternatywę dla osiągnięcia pożądanego celu, który, jak rozumiem, zasadniczo dotyczy unikania konfliktów nazw i wypróbowywania różnych funkcji, jak stwierdzono:

głównie dlatego, że restartowanie R, gdy wypróbowuję inne, konflikt pakietów staje się frustrujący, ale możliwe, że można to wykorzystać w programie do korzystania z jednej funkcji, a potem innej - chociaż odwoływanie się do przestrzeni nazw jest prawdopodobnie lepszym pomysłem

Rozwiązanie

Funkcja with_packageoferowana przez withrpakiet oferuje możliwość:

dołącz pakiet do ścieżki wyszukiwania, wykonuje kod, a następnie usuwa pakiet ze ścieżki wyszukiwania. Jednak przestrzeń nazw pakietu nie jest rozładowywana.

Przykład

library(withr)
with_package("ggplot2", {
  ggplot(mtcars) + geom_point(aes(wt, hp))
})
# Calling geom_point outside withr context 
exists("geom_point")
# [1] FALSE

geom_pointużyty w tym przykładzie nie jest dostępny z globalnej przestrzeni nazw. Myślę, że może to być czystszy sposób rozwiązywania konfliktów niż ładowanie i rozładowywanie paczek.

Pamiętaj też, że możesz użyć tylko unload()raz. Jeśli użyjesz go po raz drugi bez ponownego uruchamiania library(), otrzymasz niezbyt pouczający komunikat o błędzie, niepoprawny argument „name” :

library(vegan)
#> Loading required package: permute
#> Loading required package: lattice
#> This is vegan 2.5-6
detach("package:vegan",  unload=TRUE)
detach("package:vegan",  unload=TRUE)
#> Error in detach("package:vegan", unload = TRUE): invalid 'name' argument

^{Utworzono 2020-05-09 przez pakiet reprezentx (v0.3.0)}

Wystarczy przejść do okna WYJŚCIE, a następnie kliknąć ikonę Pakiety (znajduje się między ikonami Wykres i Pomoc ). Usuń „ tik / znacznik wyboru ” z paczki, którą chcesz rozładować.

Aby ponownie skorzystać z pakietu, po prostu umieść „ ptaszka lub znacznik wyboru ” przed paczką lub użyj:

library (lme4)

Inną opcją jest

devtools::unload("your-package")

To widocznie również zajmuje się emisją zarejestrowane S3 metod, które nie są usuwane zunloadNamespace()