Pytania i odpowiedzi dla naukowców używających komputerów do rozwiązywania problemów naukowych
Czy ktoś ma rekomendacje dotyczące użytecznej, szybkiej biblioteki macierzy C ++? Mam na myśli to, co użyteczne: Obiekty macierzy mają intuicyjny interfejs (np .: mogę używać wierszy i kolumn podczas indeksowania) Mogę zrobić wszystko z klasą macierzy, co mogę zrobić z LAPACK i BLAS Łatwy w...
Jestem głęboko przekonany o wartości stosowania testów weryfikujących pełny program (np. Testy konwergencji), w tym zautomatyzowanego zestawu testów regresji . Po przeczytaniu kilku książek o programowaniu, miałem dokuczliwe wrażenie, że „powinienem” napisać testy jednostkowe (tj. Testy, które...
Mam więc przyzwoitą uwagę, z jakimi problemami, z którymi pracuję, najlepiej rozwiązać szeregowo, i którymi można zarządzać równolegle. Ale w tej chwili nie mam pojęcia, co najlepiej poradzić sobie z obliczeniami opartymi na procesorze i co powinno zostać odciążone na GPU. Wiem, że jest to...
Mam kilka trudnych, niewypukłych problemów globalnej optymalizacji do rozwiązania. Obecnie używam MATLAB's Optimization Toolbox (konkretnie fmincon()z algorytmem = 'sqp'), co jest dość skuteczne . Jednak większość mojego kodu znajduje się w języku Python i chciałbym również przeprowadzić...
To pytanie jest rozszerzeniem dwóch dyskusji, które pojawiły się ostatnio w odpowiedziach na „ C ++ vs Fortran for HPC ”. I jest to trochę więcej wyzwanie niż pytanie ... Jednym z najczęściej słyszanych argumentów na korzyść Fortrana jest to, że kompilatory są po prostu lepsze. Ponieważ większość...
Pracuję w nauce obliczeniowej, w wyniku czego spędzam nietrywialną ilość czasu próbując zwiększyć naukową przepustowość wielu kodów, a także zrozumieć ich efektywność. Załóżmy, że oceniłem wydajność w porównaniu do czytelności / możliwości ponownego użycia / konserwacji kompromisu oprogramowania,...
W moim programie doktoranckim z zakresu obliczeń pracujemy prawie wyłącznie w C ++ i Fortran. Wygląda na to, że niektórzy profesorowie wolą jeden od drugiego. Zastanawiam się, który z nich jest „lepszy” lub czy w pewnych okolicznościach jest lepszy od
Rozważam naukę nowego języka do wykorzystania w projektach modelowania numerycznego / symulacyjnego, jako (częściowego) zamiennika dla C ++ i Pythona, którego obecnie używam. Natknąłem się na Julię , co brzmi trochę perfekcyjnie. Jeśli zrobi wszystko, co twierdzi, mógłbym go użyć do zastąpienia...
Fast Fourier Transform algorytm oblicza rozkładu Fouriera przy założeniu, że punkty wejściowe są równo rozłożone w dziedzinie czasu . Co jeśli nie są? Czy istnieje inny algorytm, którego mógłbym użyć, lub w jakiś sposób zmodyfikować FFT, aby uwzględnić efektywną zmienną częstotliwość...
Wiele algorytmów numerycznych (integracja, różnicowanie, interpolacja, funkcje specjalne itp.) Jest dostępnych w bibliotekach obliczeń naukowych, takich jak GSL . Ale często widzę kod z „ręcznie walcowanymi” implementacjami tych funkcji. Czy w przypadku małych programów, które niekoniecznie są...
Każdy naukowiec musi się trochę dowiedzieć o statystykach: co oznacza korelacja, jaki jest przedział ufności i tak dalej. Podobnie każdy naukowiec powinien wiedzieć trochę o informatyce: pytanie brzmi: co? Czego można oczekiwać od każdego pracującego naukowca, który wie o tworzeniu i korzystaniu z...
W aplikacjach pojawiają się rzadkie systemy liniowe. Do rozwiązania tych systemów jest wiele procedur do wyboru. Na najwyższym poziomie istnieje przełom między metodami bezpośrednimi (np. Rzadka eliminacja Gaussa lub rozkład Choleskiego, ze specjalnymi algorytmami porządkowania i metodami...
Istnieje oczywista różnica między różnicą skończoną a metodą objętości skończonej (przejście od definicji punktowej równań do średnich całkowitych nad komórkami). Ale uważam, że FEM i FVM są bardzo podobne; oba używają integralnej formy i średniej ponad komórkami. Co robi metoda MES, a nie FVM?...
Przyzwyczaiłem się myśleć o różnicach skończonych jako szczególnym przypadku elementów skończonych na bardzo ograniczonej siatce. Jakie są zatem warunki wyboru między metodą różnic skończonych (FDM) a metodą elementów skończonych (FEM) jako metodą numeryczną? Po stronie metody różnic skończonych...
Wiele razy, kiedy odziedziczyłem lub napotkałem kod naukowy napisany przez innych ludzi (lub czasami nawet moją własną pracę), zauważyłem, że dokumentacja jest albo rzadka, albo nie istnieje. Jeśli mam szczęście, widzę pouczające komentarze. Jeśli mam szczęście, są nawet komentarze Doxygen i...
Na moich kursach analizy numerycznej nauczyłem się analizować wydajność algorytmów, licząc liczbę wymaganych operacji zmiennoprzecinkowych (klap) w stosunku do wielkości problemu. Na przykład w tekście Trefethen & Bau na temat numerycznej algebry liniowej są nawet trójwymiarowe zdjęcia liczby...
Przepraszam, jeśli jest to niejasne pytanie, ale oto: W ciągu ostatnich kilku lat programowanie funkcjonalne cieszyło się dużym zainteresowaniem społeczności inżynierów oprogramowania. Wielu zaczęło używać języków takich jak Scala i Haskell i odniosło sukces w porównaniu z innymi językami...
Fortran zajmuje szczególne miejsce w programowaniu numerycznym. Z pewnością możesz tworzyć dobre i szybkie oprogramowanie w innych językach, ale Fortran nadal działa bardzo dobrze pomimo swojego wieku. Co więcej, łatwiej jest tworzyć szybkie programy w Fortran. Robiłem szybkie programy w C ++, ale...
Oceniając jakość oprogramowania, którego zamierzasz użyć (niezależnie od tego, czy jest to coś, co napisałeś, czy puszki w puszce) w pracy obliczeniowej, często dobrym pomysłem jest sprawdzenie, jak dobrze działa na standardowych zestawach danych lub problemach. Gdzie można uzyskać te testy do...
W mojej dziedzinie badań specyfikacja błędów eksperymentalnych jest powszechnie akceptowana, a publikacje, które ich nie dostarczają, są bardzo krytykowane. Jednocześnie często stwierdzam, że wyniki obliczeń numerycznych są podawane bez uwzględnienia błędów numerycznych, mimo że (a może dlatego,...