Dlaczego nie chcesz instalować aktualizacji?

9

Dostaję błędy, myślę, że z coreutils, gdzie yum się nie zaktualizuje. Oto zmniejszone dane wyjściowe z tego, co widzę po uruchomieniu yum update:

Resolving Dependencies
There are unfinished transactions remaining. You might consider running yum-complete-transaction first to finish them.
The program yum-complete-transaction is found in the yum-utils package.
--> Running transaction check
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.el6 will be updated
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.1.el6 will be an update
... more of the same, and then:
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
... then more of the same    --> Finished Dependency Resolution
--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package kernel.x86_64 0:2.6.32-431.17.1.el6 will be erased
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
           Requires: coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Removing: coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
               coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Updated By: coreutils-8.4-37.el6.x86_64 (base)
               coreutils = 8.4-37.el6
 You could try using --skip-broken to work around the problem
** Found 71 pre-existing rpmdb problem(s), 'yum check' output follows:
audit-libs-2.3.7-5.el6.x86_64 is a duplicate with audit-libs-2.2-4.el6_5.x86_64
audit-libs-python-2.3.7-5.el6.x86_64 is a duplicate with audit-libs-python-2.2-4.el6_5.x86_64
... then lots more like the above duplicate

Mam inny serwer (prawie) identyczny z tym (są zrównoważone pod względem obciążenia i działają z tego samego obrazu) i że nie ma tego samego problemu. Jaki może być problem i jak najlepiej postępować?

Aktualizacja:

Uruchomiłem również to, yum-complete-transactionco się nie udało i powiedziałem, że zmieniło nazwę plików transakcyjnych. Nadal mówi, że jest niekompletna transakcja, ale teraz dzieje się tak, gdy ją uruchamiam:

[root@nico ~]# yum-complete-transaction
Loaded plugins: fastestmirror
Loading mirror speeds from cached hostfile
 * webtatic: uk.repo.webtatic.com
drivesrvr                                                                                                                                                                                                                                |  951 B     00:00
There are 1 outstanding transactions to complete. Finishing the most recent one
The remaining transaction had 252 elements left to run
... lots of:
Package name-1.23.x8x_64 already installed and latest version
...
--> Running transaction check
... lots of entries like this:
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.el6 will be updated
... and this:
---> Package PyYAML.x86_64 0:3.10-3.1.el6 will be an update
... and this:
---> Package audit-libs.x86_64 0:2.2-4.el6_5 will be erased
Killed

Nagle zatrzymuje się wraz z Killedlinią.

Próbowałem uruchomić yum update --skip-brokendalej:

[root@nico ~]# yum update --skip-broken
Freeing read locks for locker 0x7d: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x7f: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x80: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x81: 28940/139976145426176
Freeing read locks for locker 0x82: 28940/139976145426176
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Setting up Update Process
Loading mirror speeds from cached hostfile
 * webtatic: uk.repo.webtatic.com
drivesrvr                                                                                                                                                                                                                                |  951 B     00:00
Resolving Dependencies
There are unfinished transactions remaining. You might consider running yum-complete-transaction first to finish them.
--> Running transaction check
... lots of will be updated/will be an update/etc, then:
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64

Potem jeszcze kilka Running transaction check:sekund i Processing Dependency: coreutils =...wpisy wśród kolejnych willy be updated/willbe an updatewpisów. Następnie:

Packages skipped because of dependency problems:
    coreutils-8.4-37.el6.x86_64 from base

Dependencies Resolved

Wtedy ja pokazano tabelę z listą Installing:i Updating:pakietów, z podsumowaniem na koniec:

Install       2 Package(s)
Upgrade      79 Package(s)
Remove        1 Package(s)

Następnie pobiera wszystkie pakiety (81/81 pomyślnie) i na koniec pokazuje:

Total                                                                                                                                                                                                                           3.0 MB/s | 115 MB     00:37
Running rpm_check_debug
Killed

Aktualizacja 2:

Pobiegłem też yum clean alli miałem trochę problemów. Znalazłem porady dotyczące usuwania __db*plików i spróbuj ponownie:

[root@nico ~]# yum clean all
rpmdb: Thread/process 29404/139880514733824 failed: Thread died in Berkeley DB library
error: db3 error(-30974) from dbenv->failchk: DB_RUNRECOVERY: Fatal error, run database recovery
error: cannot open Packages index using db3 -  (-30974)
error: cannot open Packages database in /var/lib/rpm
CRITICAL:yum.main:

Error: rpmdb open failed
[root@nico ~]# rm -f /var/lib/rpm/__db*
[root@nico ~]# yum clean all
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Cleaning repos: base drivesrvr epel extras ius newrelic percona-release-noarch percona-release-x86_64 rackspace updates webtatic
Cleaning up Everything
Cleaning up list of fastest mirrors
[root@nico ~]# yum clean all
Loaded plugins: downloadonly, fastestmirror, replace
Cleaning repos: base drivesrvr epel extras ius newrelic percona-release-noarch percona-release-x86_64 rackspace updates webtatic
Cleaning up Everything
[root@nico ~]#

Aktualizacja 3:

Śledziłem /var/log/messagesi widziałem dużo wyników, gdy biegłem yum-complete-transaction, z których dwie ostatnie linie to:

Nov 14 08:19:47 nico kernel: Out of memory: Kill process 30995 (yum-complete-tr) score 149 or sacrifice child
Nov 14 08:19:47 nico kernel: Killed process 30995, UID 0, (yum-complete-tr) total-vm:641952kB, anon-rss:181420kB, file-rss:4kB

Prawdopodobnie sugeruje to, że jest to związane z pamięcią. Jeśli tak, to czy jest to potrzeba większej ilości pamięci RAM, czy może jest inny problem, który muszę zbadać?

centos yum Leonard Challis
źródło
2
Czy sprawdziłeś dzienniki systemowe? Być może kończy się pamięć.
Michael Hampton
Tak, właśnie zaktualizowałem pytanie (aktualizacja 3) informacjami o pamięci, myślę, że masz rację.
Leonard Challis

Odpowiedzi:

6

Podobny problem - i moja poprawka. Miałem też problem z pamięcią, więc musiałem zaktualizować pamięć VPS. Potem zrobiłem mniam aktualizację - oczywiście otrzymałem błędy jak wyżej. Spojrzałem na nieudaną i zauważyłem, że to, co się stało, to że Yum zainstalował (no cóż, zaczął instalować) najnowszy coreutils - wersję 37, podczas gdy wciąż miałem bity 31. Więc najpierw usunąłem wersję 37, a następnie wyczyściłem, a następnie uruchomiłem aktualizację yum jeszcze raz.

To spowodowało, że wersja „31” była „czysto” zaktualizowana. Zobacz pracę poniżej:

--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
--> Processing Dependency: coreutils = 8.4-31.el6_5.2 for package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
--> Finished Dependency Resolution
Error: Package: coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
           Requires: coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Removing: coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64 (@updates)
               coreutils = 8.4-31.el6_5.2
           Updated By: coreutils-8.4-37.el6.x86_64 (base)
               coreutils = 8.4-37.el6
 You could try using --skip-broken to work around the problem

Bieganie yum remove coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64:

Loaded plugins: fastestmirror
Setting up Remove Process
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6 will be erased
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved
==============================
========================================================================================

Package                         Arch                    Version                    Repository                  Size
======================================================================================================================
Removing:
 coreutils-libs                  x86_64                  8.4-37.el6                  installed                  5.4 k

Transaction Summary
======================================================================================================================
Remove        1 Package(s)

Installed size: 5.4 k
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
  Erasing    : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/1 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/1 

Removed:
  coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6                                                                                  

Complete!

Czyszczenie za pomocą yum clean all:

Loaded plugins: fastestmirror
Cleaning repos: base extras updates
Cleaning up Everything
Cleaning up list of fastest mirrors

Odświeżanie listy pakietów yum update:

Loaded plugins: fastestmirror
Setting up Update Process
Determining fastest mirrors
 * base: mirrors.lga7.us.voxel.net
 * extras: mirrors.lga7.us.voxel.net
 * updates: mirror.cc.columbia.edu
base                                                                                           | 3.7 kB     00:00     
base/primary_db                                                                                | 4.6 MB     00:00     
extras                                                                                         | 3.4 kB     00:00     
extras/primary_db                                                                              |  30 kB     00:00     
updates                                                                                        | 3.4 kB     00:00     
updates/primary_db                                                                             | 1.5 MB     00:00     
Resolving Dependencies
--> Running transaction check
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
---> Package coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-31.el6_5.2 will be updated
---> Package coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6 will be an update
--> Finished Dependency Resolution

Dependencies Resolved

======================================================================================================================
 Package                          Arch                     Version                       Repository              Size
======================================================================================================================
Updating:
 coreutils                        x86_64                   8.4-37.el6                    base                   3.0 M
 coreutils-libs                   x86_64                   8.4-37.el6                    base                    50 k

Transaction Summary
======================================================================================================================
Upgrade       2 Package(s)

Total download size: 3.1 M
Is this ok [y/N]: y
Downloading Packages:
(1/2): coreutils-8.4-37.el6.x86_64.rpm                                                         | 3.0 MB     00:00     
(2/2): coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64.rpm                                                    |  50 kB     00:00     
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Total                                                                                  44 MB/s | 3.1 MB     00:00     
Running rpm_check_debug
Running Transaction Test
Transaction Test Succeeded
Running Transaction
  Updating   : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   1/4 
  Updating   : coreutils-8.4-37.el6.x86_64                                                                        2/4 
  Cleanup    : coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                               3/4 
  Cleanup    : coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                                    4/4 
  Verifying  : coreutils-8.4-37.el6.x86_64                                                                        1/4 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-37.el6.x86_64                                                                   2/4 
  Verifying  : coreutils-libs-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                               3/4 
  Verifying  : coreutils-8.4-31.el6_5.2.x86_64                                                                    4/4 

Updated:
  coreutils.x86_64 0:8.4-37.el6                           coreutils-libs.x86_64 0:8.4-37.el6                          

Complete!

-Łyk.

Jan
źródło
11

Zwykle powodem yumśmierci Killedjest brak pamięci w systemie.

Z dzienników wygląda na to, że masz instancję Amazon t1.micro lub coś podobnego rozmiaru i bez przestrzeni wymiany. Ta ograniczona ilość pamięci często nie wystarcza do ukończenia dużej liczby instalacji / aktualizacji pakietów.

Aby rozwiązać problem:

  1. Zamknij działające usługi, dopóki nie będziesz mieć wystarczającej ilości pamięci, aby sfinalizować transakcję yum.

    Lub...

  2. Dodaj plik wymiany lub swap w efemerycznym magazynie do instancji.

Następnie powinieneś być w stanie ukończyć swoje transakcje mniam.

Wreszcie, aby usunąć problemy z pakietem z poprzednich nieudanych aktualizacji, spróbuj

package-cleanup --cleandupes

przed wykonaniem jakichkolwiek innych aktualizacji.

Michael Hampton
źródło
1
Możesz również skorzystać z okazji, aby przejść do instancji t2.micro, która ma więcej pamięci, jest zwykle szybsza i tańsza.
Michael Hampton
Dziękuję Ci. Trzeba było zatrzymać httpd, ale wszystko działało, a potem też zostało wyczyszczone.
Leonard Challis
2

Spróbuj you update --skip-brokenpominąć uszkodzone pakiety (możesz sobie z nimi poradzić później), prawdopodobnie dobrym pomysłem jest uruchomienie yum clean allprzed zrobieniem czegokolwiek.

Alexus
źródło
1

Filtrowanie obcych informacji, które zacytowałeś i w połowie yumjuż próbuje ci pomóc:

Pozostały niedokończone transakcje. Możesz rozważyć uruchomienie yum-complete-transactionnajpierw, aby je ukończyć. Program „pełna-transakcja yum” znajduje się w pakiecie yum-utils.

Próbowałeś już tego?

HBruijn
źródło
Tak, faktycznie to zrobiłem. Powiedział mi, że nie można go ukończyć i zmienił nazwę plików transakcyjnych
Leonard Challis
Dodałem więcej szczegółów do pytania z przykładami, kiedy coś się nie udaje.
Leonard Challis
0

Wypróbuj

mniam starsza nazwa pakietu

Nie jestem pewien, dlaczego, ale aktualizuje, a przynajmniej zrobił to dla mnie z pakietem tcpdump. Poszedłem z wersji tcpdump-4.5.1-2.el7.x86_64 do tcpdump-4.7.4-1_ESG_ring.x86_64, co jest tym, czego chciałem.

hokie1999
źródło