Czy można utworzyć wykres „zestawów równoległych” za pomocą R?

16

Dzięki pytaniu Tormod (zamieszczonemu tutaj ) natrafiłem na fabułę zestawów równoległych . Oto przykład tego, jak to wygląda: wprowadź opis zdjęcia tutaj (Jest to wizualizacja zestawu danych Titanica. Pokazuje, na przykład, że większość kobiet, które nie przeżyły, należy do trzeciej klasy ...)

Chciałbym móc odtworzyć taki spisek z R. Czy to możliwe?

Dzięki, Tal

Tal Galili
źródło
1
Aby uzyskać pomysły na grafikę, zawsze sprawdzam galerię wykresów R. Oto coś, co przypomina nieco to, o co prosisz: R Graph Gallery równolegle . Znalazłem go, klikając równolegle w chmurze znaczników, ale mogą istnieć lepsze opcje.
Nick Sabbe,
1
Dzięki Nick. Ale to nie zadziała w przypadku danych kategorycznych bez gruntownej modyfikacji kodu (prawdopodobnie nie jest to również najlepsza baza funkcji do zbudowania tego). Mam nadzieję, że ktoś już zrobił coś podobnego ...
Tal Galili,

Odpowiedzi:

25

Oto wersja wykorzystująca tylko podstawową grafikę, dzięki komentarzowi Hadleya. (W przypadku poprzedniej wersji zobacz historię edycji).

trzecia próba

parallelset <- function(..., freq, col="gray", border=0, layer, 
                             alpha=0.5, gap.width=0.05) {
  p <- data.frame(..., freq, col, border, alpha, stringsAsFactors=FALSE)
  n <- nrow(p)
  if(missing(layer)) { layer <- 1:n }
  p$layer <- layer
  np <- ncol(p) - 5
  d <- p[ , 1:np, drop=FALSE]
  p <- p[ , -c(1:np), drop=FALSE]
  p$freq <- with(p, freq/sum(freq))
  col <- col2rgb(p$col, alpha=TRUE)
  if(!identical(alpha, FALSE)) { col["alpha", ] <- p$alpha*256 }
  p$col <- apply(col, 2, function(x) do.call(rgb, c(as.list(x), maxColorValue = 256)))
  getp <- function(i, d, f, w=gap.width) {
    a <- c(i, (1:ncol(d))[-i])
    o <- do.call(order, d[a])
    x <- c(0, cumsum(f[o])) * (1-w)
    x <- cbind(x[-length(x)], x[-1])
    gap <- cumsum( c(0L, diff(as.numeric(d[o,i])) != 0) )
    gap <- gap / max(gap) * w
    (x + gap)[order(o),]
  }
  dd <- lapply(seq_along(d), getp, d=d, f=p$freq)
  par(mar = c(0, 0, 2, 0) + 0.1, xpd=TRUE )
  plot(NULL, type="n",xlim=c(0, 1), ylim=c(np, 1),
       xaxt="n", yaxt="n", xaxs="i", yaxs="i", xlab='', ylab='', frame=FALSE)
  for(i in rev(order(p$layer)) ) {
     for(j in 1:(np-1) )
     polygon(c(dd[[j]][i,], rev(dd[[j+1]][i,])), c(j, j, j+1, j+1),
             col=p$col[i], border=p$border[i])
   }
   text(0, seq_along(dd), labels=names(d), adj=c(0,-2), font=2)
   for(j in seq_along(dd)) {
     ax <- lapply(split(dd[[j]], d[,j]), range)
     for(k in seq_along(ax)) {
       lines(ax[[k]], c(j, j))
       text(ax[[k]][1], j, labels=names(ax)[k], adj=c(0, -0.25))
     }
   }           
}

data(Titanic)
myt <- subset(as.data.frame(Titanic), Age=="Adult", 
              select=c("Survived","Sex","Class","Freq"))
myt <- within(myt, {
  Survived <- factor(Survived, levels=c("Yes","No"))
  levels(Class) <- c(paste(c("First", "Second", "Third"), "Class"), "Crew")
  color <- ifelse(Survived=="Yes","#008888","#330066")
})

with(myt, parallelset(Survived, Sex, Class, freq=Freq, col=color, alpha=0.2))
Aaron opuścił Stack Overflow
źródło
Aaron, wow, fantastyczna odpowiedź - chciałbym móc oznaczyć to dwa razy V. Dziękuję Ci!
Tal Galili
2
Cieszę się że to lubisz. To była zabawa. :) Jedyną trudną częścią jest ustalenie miejsc, w których paski powinny się zaczynać i kończyć (co znajduje się w getppodfunkcji); reszta to tylko rysowanie wielokątów.
Aaron opuścił Stack Overflow
1
Po prostu kolejna panel.textlinia. Zobacz edycję.
Aaron opuścił Stack Overflow
1
Możesz także zrobić przezroczystość w grafice podstawowej.
hadley
2
Masz rację. Zupełnie o tym zapomniałem, będąc tak przyzwyczajonym do kratowego sposobu robienia rzeczy. Dla innych, którzy są zainteresowani, na przykład dodajesz kilka znaków do swojego ciągu kolorów, na przykład #FF000080. ?rgbma szczegóły.
Aaron opuścił Stack Overflow