Korekta dla wielokrotnych porównań ANOVA w obrębie badanych / powtarzanych pomiarów; nadmiernie konserwatywny?

9

Uderza mnie, że dostępne poprawki do wielokrotnych porównań w kontekście ANOVA z powtarzanymi pomiarami są zbyt konserwatywne. Czy tak jest w rzeczywistości? Jeśli tak, to jakich cytatów mogę użyć, aby poprzeć ten punkt i dowiedzieć się więcej?

russellpierce
źródło
Do jakiego rodzaju korekcji MP również mówisz? (BTW, dlaczego alphatag?)
chl
1
ponownie znacznik alfa: Tylko dlatego, że poprawki zwykle mają na celu utrzymanie stałej alfa.
russellpierce
Nie jestem pewien, co oznacza skrót MP w tym kontekście, ale mówię o często używanych poprawkach wielokrotnych porównań Bonferroni i / lub Sidaka.
russellpierce
Wiem, że istnieją inne podejścia, np. Współczynnik fałszywych odkryć itd., Ale szczególnie staram się oceniać i krytykować częściej stosowane podejścia.
russellpierce
1
Kiedy wciąż się rozglądam, wydają się istnieć dwa obozy ... ci, którzy mają „lepsze podejście” za pomocą zbiorczego terminu błędu i ci, którzy chcą dostosować wartość p według pewnego rodzaju procedury wielokrotnego porównywania (Bonferonni, Holm ... itd. itd. ... wydaje się, że jest ich więcej niż mam palce).
russellpierce

Odpowiedzi:

4

Według mojej najlepszej wiedzy, wspólny rozkład kontrastów liniowych wyprowadzono w prostym przypadku ANOVA (patrz dokumentacja pakietu multcomp R), ale nie ma zamkniętych formularzy dla konfiguracji powtarzanych pomiarów. Niemniej jednak zawsze można uruchomić Bootstrap rozkład połączeń tych kontrastów liniowych poniżej wartości zerowej i spojrzeć na minimalną statystykę t (lub maksymalną wartość p) w celu ustawienia progu istotności za pomocą kontroli FWE. Jak zasugerowałeś, możesz używać metod, które wymagają jedynie pewnych warunków jakościowych przy wspólnym rozkładzie statystyk testowych. Bonferroni to dobra opcja, jeśli masz niewiele kontrastów. W przeciwnym razie spójrz na Holma . Jeśli patrzysz na wiele kontrastów liniowych, zdecydowanie powinieneś zadać sobie pytanie, od czego chcesz ochronykażde fałszywe odkrycie lub tylko część fałszywych odkryć. W tym drugim przypadku użyj procedury BH do kontroli FDR.

JohnRos
źródło
1

Oto zbiór linków do forum SPSS. Mam nadzieję, że w pewnym stopniu uważasz to za istotne: to , to , to , to .

ttnphns
źródło
1
Dzięki za wskazanie kierunku. Niestety posty grup dyskusyjnych są dalekie od przekonujących dowodów podczas omawiania tych kwestii w opublikowanych pracach. Ogólny elementarz sferyczności jest interesujący i wskazuje, dlaczego korekty wartości p Bonferroni-stype są nadal w powszechnym użyciu. Niestety tak naprawdę nie ma oskarżenia o konserwatywny charakter tego podejścia.
russellpierce