Pakiet R do łączenia wartości p za pomocą metody Fishera lub Stouffera

10

Czy istnieje pakiet R (lub nawet podstawowa funkcja R), który implementuje metodę Fishera lub Stouffera do łączenia wartości p? Kodowanie tego powinno być prawie trywialne, ale wolałbym użyć (i zacytować) pakiet.

Przykładowy kod w tym pytaniu: Metoda Fishera do czesania wartości p - co z dolnym ogonem?

r combining-p-values krlmlr
źródło

8

metapPakiet Michaela Dewey realizuje wiele sposobów łączenia wartości p:

sumlog: Metoda Fishera
sumz: Wygląda jak metoda Stouffera (z wagami), nie jest to wyraźnie wymienione w dokumentacji funkcji, ale potwierdzone w winiecie roboczej (która nie jest jeszcze częścią pakietu)
meanp: Łącząc wartości p, dlaczego nie po prostu uśrednić?
...

krlmlr
źródło

Winieta jest teraz w pakiecie rozproszonym.

mdewey,

3

Jest także combine.testfunkcja w survcomppakiecie (na Bioconductor). Implementuje metodę Fishera i Stouffera, a także metodę logit.

krlmlr
źródło

survcompdziała również w przypadku pojedynczej pvalue, obsługuje brakujące wartości w bardziej spójny sposób z bazą r i zachęca do wkładów, zapewniając oficjalne repo.

jan-glx

Pakiet R do łączenia wartości p za pomocą metody Fishera lub Stouffera

Odpowiedzi: