Różnica między ElasticNet w scikit-learn Python i Glmnet w R.

11

Czy ktoś próbował sprawdzić, czy dopasowanie modelu elastycznej sieci ElasticNetw scikit-learn w Pythonie i glmnetR do tego samego zestawu danych daje identyczne wyniki arytmetyczne? Eksperymentowałem z wieloma kombinacjami parametrów (ponieważ dwie funkcje różnią się wartościami domyślnymi, które przekazują argumentom), a także skalowaniem danych, ale wydaje się, że nic nie daje takiego samego modelu między dwoma językami. Czy ktoś miał ten sam problem?

Dionysis M.
źródło

Odpowiedzi:

6

Wreszcie mam te same wartości z następującym kodem:

Pyton

# normalize function that gives the same with R
def mystandardize(D):
   S = np.std(D, axis=0, ddof=1)
   M = np.mean(D, axis = 0)
   D_norm = (D-M)/S
return [D_norm, M, S]

Y_norm_train = pd.DataFrame(mystandardize(Y_train)[0])
glmnet_regr = linear_model.ElasticNet(alpha=1, l1_ratio = 0.01,
                                  fit_intercept = True, normalize =    False, tol=0.0000001, max_iter = 100000)
glmnet_regr.fit(X_train, Y_norm_train)

R

y_norm_train <- scale(y[train_idx])
glmnet_obj_norm <- glmnet(x_train, y_norm_train, alpha=0.01, lambda = 1,  
                   thresh = 1e-07, standardize = FALSE, intercept=TRUE, standardize.response = FALSE)
print_coef(glmnet_obj_norm)
Dionysis M.
źródło
3
Jest to stosunkowo nowa owijka pyton kodu Fortran stosowanego w R opakowania glmnet. Powinno to również uzyskać takie same wyniki jak w R . github.com/civisanalytics/python-glmnet
Jordi