Liniowe modele efektów mieszanych

13

Często słyszałem, że modele LME są bardziej wiarygodne w analizie danych dokładności (tj. W eksperymentach psychologicznych), ponieważ mogą pracować z rozkładami dwumianowymi i innymi niestandardowymi rozkładami, których tradycyjne podejścia (np. ANOVA) nie mogą.

Jakie są matematyczne podstawy modeli LME, które pozwalają im uwzględnić te inne rozkłady i jakie są niektóre niezbyt techniczne opracowania?

Mike Wong
źródło

Odpowiedzi:

15

Jedną z głównych korzyści modeli mieszanych jest to, że nie zakładają one niezależności między obserwacjami, a obserwacje mogą być skorelowane w obrębie jednostki lub skupienia.

Jest to zwięźle omówione w „Modern Applied Statistics with S” (MASS) w pierwszej części rozdziału 10 na temat „efektów losowych i mieszanych”. V&R przedstawia przykład z danymi benzyny porównującymi ANOVA i lme w tej sekcji, więc jest to dobry przegląd. Funkcja R do stosowania w lmew nlmeopakowaniu.

Sformułowanie modelu oparte jest na Laird i Ware (1982), więc możesz nazywać to głównym źródłem, choć na pewno nie jest dobre na wprowadzenie.

  • Laird, NM i Ware, JH (1982) „Modele efektów losowych dla danych podłużnych”, Biometrics, 38, 963–974.
  • Venables, WN i Ripley, BD (2002) „ Modern Applied Statistics with S ”, wydanie 4, Springer-Verlag.

Możesz także zajrzeć do dodatku „Liniowe modele mieszane” (PDF) do „An R and S-PLUS Companion for Applied Regression” Johna Foxa. I ten wykład Rogera Levy'ego (PDF) omawia modele efektów mieszanych z rozkładem normalnym wielu zmiennych.

Shane
źródło
Wow, Shane, dzięki za bardzo szybką odpowiedź! Przejrzę te referencje!
Mike Wong
10

Bardzo dobrym artykułem wyjaśniającym ogólne podejście LMM i ich przewagę nad ANOVA jest:

Liniowe modele mieszanych efektów (LMM) uogólniają modele regresji, aby miały składowe podobne do resztkowych, losowe efekty na poziomie np. Ludzi lub przedmiotów, a nie tylko na poziomie indywidualnych obserwacji. Modele są bardzo elastyczne, na przykład umożliwiają modelowanie różnych nachyleń i przechwytów.

LMM działają przy użyciu pewnego rodzaju funkcji wiarygodności, prawdopodobieństwa danych przy określonym parametrze oraz metody maksymalizacji tego (Maksymalne oszacowanie wiarygodności; MLE) poprzez manipulowanie parametrami. MLE jest bardzo ogólną techniką pozwalającą na dopasowanie wielu różnych modeli, np. Danych binarnych i danych zliczeniowych, i jest wyjaśniona w wielu miejscach, np.

  • Agresti, A. (2007). Wprowadzenie do analizy danych kategorialnych (wydanie drugie) . John Wiley & Sons.

LMM nie mogą jednak radzić sobie z danymi innymi niż gaussowskie, takimi jak dane binarne lub liczby; do tego potrzebujesz uogólnionych liniowych modeli mieszanych efektów (GLMM). Jednym ze sposobów na ich zrozumienie jest zbadanie GLM; patrz także Agresti (2007).

AndyF
źródło
Czy są sytuacje, w których nie należy wybierać lmm zamiast anova?
Ben
8

Główną zaletą LME do analizy danych dokładności jest możliwość uwzględnienia szeregu efektów losowych. W eksperymentach psychologicznych badacze zwykle agregują przedmioty i / lub uczestników. Ludzie nie tylko różnią się od siebie, ale także przedmioty (niektóre słowa mogą być na przykład bardziej charakterystyczne lub zapadające w pamięć). Ignorowanie tych źródeł zmienności zwykle prowadzi do niedoszacowania dokładności (na przykład niższych wartości d '). Chociaż kwestią agregacji uczestnika można w jakiś sposób poradzić sobie z indywidualnym oszacowaniem, efekty pozycji nadal istnieją i są zwykle większe niż efekty uczestnika. LME pozwala nie tylko jednocześnie radzić sobie z obydwoma efektami losowymi, ale także dodawać do nich dodatkowe zmienne predykcyjne (wiek, poziom wykształcenia, długość słowa itp.).

Naprawdę dobrym odniesieniem dla LME, szczególnie skoncentrowanych na lingwistyce i psychologii eksperymentalnej, jest Analiza danych lingwistycznych: praktyczne wprowadzenie do statystyki za pomocą R

Twoje zdrowie

Dave Kellen
źródło
2
... iw tym duchu również pakiet lme4 (który jest łatwiejszy w użyciu niż lme lub nlme) i powiązane pakiety z wyżej wspomnianej książki Baayen, languageR.
russellpierce
dzięki za komentarz, całkowicie się z tobą zgadzam. lme4 jest po prostu najlepszy.
Dave Kellen