Obecny komputer Mac Mini wykorzystuje dwurdzeniowy 64-bitowy procesor „Penryn” Intel Core 2 Duo, który działa z częstotliwością 2,4 lub 2,66 GHz. Każdy procesor ma wbudowaną pamięć podręczną L2 3 MiB, która jest współdzielona przez dwa rdzenie. W poprzednich wersjach stosowano układy Core 2 Duo oparte na „Merom” oraz układy Core Duo i Solo oparte na „Yonah”.
Podczas gdy Mac Mini G4 zawierał osobny procesor graficzny, wszystkie wersje Mac Mini z procesorem Intel zawierają zintegrowane procesory graficzne. We wczesnym wprowadzaniu na rynek Maca Mini G4 firmy Apple, reklamowano wyższość zastosowania dyskretnej karty graficznej ATI Radeon 9200 32 MiB w porównaniu ze zintegrowaną grafiką zawartą w wielu budżetowych komputerach. [27] Intel GMA, który został wbudowany w Maca Mini, został skrytykowany za wytwarzanie jąkającego się wideo, pomimo wsparcia sprzętowego odtwarzania wideo w standardzie H.264 i rozczarowującej liczby klatek na sekundę w intensywnych graficznie grach 3D. [28] Jednak Nvidia GeForce 320M w obecnym modelu jest uważana za najszybszy zintegrowany procesor graficzny na rynku i reklamowana przez Apple jako dwukrotnie szybsza niż Nvidia GeForce 9400M stosowana w poprzednich modelach.