Niedawno otrzymałem sekwencer genomu (DNA) MinION USB, który, ku mojemu rozczarowaniu, nie działa poprawnie w Ubuntu.
Korzystam z wersji Ubuntu 12.04. Sekwencer jest poprawnie wykrywany przez skrypt / sterownik, który jest z nim dostarczany, ale wydaje się, że nie jest w stanie wykryć próbki.
Załączam zrzut ekranu z procesu. Każda pomoc byłaby bardzo mile widziana!
gksuOdpowiedzi:
Ponieważ skrypt jest odpowiednio wykrywany przez urządzenie, wydaje się bardziej prawdopodobne, że problem leży po stronie sekwencera genów, niż problem związany z Ubuntu. Czy są jakieś inne narzędzia, które pozwolą ci komunikować się z sekwencerem dla innych funkcji, być może rutynowej kalibracji? Jeśli Ubuntu może komunikować się z maszyną i zmuszać ją do robienia innych rzeczy, oczekiwałbym, że problem dotyczy raczej sekwencera genów niż komputera. Innym możliwym testem jest próba użycia innego systemu operacyjnego, jeśli jest dostępne oprogramowanie. Na koniec upewnij się, że sekwencer ma najnowsze oprogramowanie układowe i że oprogramowanie, którego używasz do łączenia się, jest aktualne.
źródło
Dzikie zgadywanie: czy może to być problem z uprawnieniami? Niektóre urządzenia działają OK w przypadku niektórych operacji, gdy są uruchamiane jako zwykły użytkownik, ale wymagają
rootuprawnień do wykonywania innych operacji. Dlatego możesz spróbowaćsudo ./gseqsprawdzić, czy to pomaga. Jeśli to pomaga, ale nie chceszrootcały czas działać , możesz wyśledzić pliki urządzeń i zmienić ich uprawnienia, aby uzyskać dostęp do urządzenia za pomocą zwykłego konta. Prawdopodobnie wymagałoby to stworzenia reguł udev. Nie będę wchodził w to tutaj, ponieważ to rozwiązanie jest trochę dalekie.źródło
Czy możliwe jest przekroczenie 6 godzin żywotności urządzenia? Wydaje się prawdopodobne, że jest to bardziej błąd urządzenia lub problem z procesem. Pomoc techniczna MinION powinna być Twoim głównym kontaktem w celu rozwiązania tego problemu, ponieważ wydaje się, że program komunikuje się z urządzeniem.
Chris
źródło