Budowanie ATLAS (a później Octave w / ATLAS)

Próbuję skonfigurować ATLAS (aby później skompilować oktawę z obsługą ATLAS).

Jeśli mam rację, nadal muszę to zbudować ręcznie ze względu na optymalizacje specyficzne dla środowiska. Widzę pakiet dla ATLAS, ale wygląda na to, że korzysta z ogólnych opcji kompilacji między platformami (np. „Będzie wolno”).

Tak więc uruchomienie skryptu konfiguracyjnego zgodnie z opisem w dokumentacji wydaje się iść źle. Jako programista Java nigdy nie radzę sobie dobrze z popełnianiem błędów lub błędów w tych procesach kompilacji. Czy brakuje mi zależności (jeśli tak, to czy istnieje dokumentacja dotycząca tego, czego potrzebuję)?

allusers@vbubuntu:~/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu$ ../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=3000 --with-netlib-lapack-tarfile=/home/allusers/Downloads/lapack-3.5.0.tgz

make: `xconfig' is up to date.
./xconfig -d s /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu/../ -d b /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu  -b 64 -D c -DPentiumCPS=3000 -Si lapackref 1

OS configured as Linux (1)

Assembly configured as GAS_x8664 (2)

Vector ISA Extension configured as  SSE3 (6,448)
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2

Architecture configured as  Corei1 (25)
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2

Clock rate configured as 2350Mhz
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2

Maximum number of threads configured as  4
Parallel make command configured as '$(MAKE) -j 4'
ERROR: enum fam=3, chip=2, mach=0
make[3]: *** [atlas_run] Error 44
make[2]: *** [IRunArchInfo_x86] Error 2
Cannot detect CPU throttling.
rm -f config1.out
make atlas_run atldir=/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu exe=xprobe_comp redir=config1.out \
                args="-v 0 -o atlconf.txt -O 1 -A 25 -Si nof77 0 -V 448   -b 64 -d b /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu"
make[1]: Entering directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
cd /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu ; ./xprobe_comp -v 0 -o atlconf.txt -O 1 -A 25 -Si nof77 0 -V 448   -b 64 -d b /home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu > config1.out
make[2]: gfortran: Command not found
make[2]: *** [IRunF77Comp] Error 127
make[2]: g77: Command not found
make[2]: *** [IRunF77Comp] Error 127
make[2]: f77: Command not found
make[2]: *** [IRunF77Comp] Error 127


Unable to find usable compiler for F77; abortingMake sure compilers are in your path, and specify good compilers to configure
(see INSTALL.txt or 'configure --help' for details)make[1]: *** [atlas_run] Error 8
make[1]: Leaving directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
make: *** [IRun_comp] Error 2
ERROR 512 IN SYSCMND: 'make IRun_comp args="-v 0 -o atlconf.txt -O 1 -A 25 -Si nof77 0 -V 448   -b 64"'
mkdir src bin tune interfaces
mkdir: cannot create directory ‘src’: File exists
mkdir: cannot create directory ‘bin’: File exists
mkdir: cannot create directory ‘tune’: File exists
mkdir: cannot create directory ‘interfaces’: File exists
make: *** [make_subdirs] Error 1
make -f Make.top startup
make[1]: Entering directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
Make.top:1: Make.inc: No such file or directory
Make.top:325: warning: overriding commands for target `/AtlasTest'
Make.top:76: warning: ignoring old commands for target `/AtlasTest'
make[1]: *** No rule to make target `Make.inc'.  Stop.
make[1]: Leaving directory `/home/allusers/Downloads/atlas3.10.1/build_vbubuntu'
make: *** [startup] Error 2
mv: cannot move ‘lapack-3.5.0’ to ‘../reference/lapack-3.5.0’: Directory not empty
mv: cannot stat ‘lib/Makefile’: No such file or directory
../configure: 450: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 451: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 452: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 453: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
../configure: 509: ../configure: cannot create lib/Makefile: Directory nonexistent
DONE configure

Najlepszym sposobem na zbudowanie biblioteki ATLAS dostosowanej do konkretnego procesora jest postępowanie zgodnie z instrukcjami /usr/share/doc/libatlas3-base/README.Debian(dostępnymi również do czytania online tutaj ). Instrukcje wyraźnie mówią, jak przebudować atlaspakiet źródłowy dla Debiana / Ubuntu w sposób, który da ci niestandardowe pakiety, które można zainstalować zamiast pakietów udostępnionych w oficjalnych repozytoriach.

Odpowiedni fragment README.Debianmówi:

Budowanie zoptymalizowanych pakietów Atlas na swoim ARCH

Budowanie własnych zoptymalizowanych pakietów Atlas jest proste. Wystarczy pobrać źródła pakietu i jego zależności kompilacji:

# apt-get source atlas
# apt-get build-dep atlas
# apt-get install devscripts

i wpisz następujące polecenie z podkatalogu źródłowego atlasu:

# fakeroot debian/rules custom

powinien wygenerować pakiet o nazwie:

../libatlas3-base_*.deb

zoptymalizowany pod kątem architektury, na której zbudowano Atlas. Następnie zainstaluj pakiet za pomocą dpkg -i.

Wygląda na to, że były to zależności, których potrzebował, proces kompilacji jest teraz uruchomiony. Te rzeczy nigdy nie są po prostu łatwo dokumentowane w ładnej formie materiałów eksploatacyjnych.

W przypadku Ubuntu (odpowiednio gfortran, g77 i f77):

sudo apt-get install gfortran f2c libcnf-dev

Ponadto każdy, kto znajdzie to pytanie, może znaleźć powiązane z nim pytanie dotyczące użycia Stackoverflow:

/programming/23876286/building-octave-from-source-did-atlas-get-included-properly-in-octaves-confi