Jak policzyć liczbę znaków w linii, z wyjątkiem określonego znaku?

To jest plik części

N W N N N N N N N N N
N C N N N N N N N N N
N A N N N N N N N N N
N N N N N N N N N N N
N G N N N N N N N N N
N C N N N C N N N N N
N C C N N N N N N N N

W każdym wierszu chcę policzyć całkowitą liczbę wszystkich znaków, które nie są „N”

moje pragnienie wyjściowe

1
1
1
0
1
2
2

Rozwiązanie GNU awk :

awk -v FPAT='[^N[:space:]]' '{ print NF }' file

• FPAT='[^N[:space:]]'- wzorzec definiujący wartość pola (dowolny znak z wyjątkiem Nznaku i białych znaków)

Oczekiwana wydajność:

1
1
1
0
1
2
2

awk '{ gsub("[ N]",""); print length() }'

zakładając, że liczba jest potrzebna dla każdej linii innej niż znak spacji i N

$ perl -lne 'print tr/N //c' ip.txt 
1
1
1
0
1
2
2

• wartość zwracana trto ile znaków zostało zastąpionych
• c w celu uzupełnienia zestawu podanych znaków
• Zwróć uwagę na użycie -lopcji, usuwa znak nowej linii z linii wprowadzania, aby uniknąć błędu off-by-one, a także dodaje znak nowej linii do instrukcji print

Bardziej ogólne rozwiązanie

perl -lane 'print scalar grep {$_ ne "N"} @F' ip.txt 

• -aopcja automatycznego podziału linii wejściowej na białe spacje, zapisana w @Ftablicy
• grep {$_ ne "N"} @Fzwraca tablicę wszystkich elementów, w @Fktórych nie pasuje ciągN
  • odpowiednikiem wyrażenia regularnego byłoby grep {!/^N$/} @F
• użycie scalarda da liczbę elementów tablicy

Alternatywne rozwiązanie awk :

awk '{ print gsub(/[^N[:space:]]/,"") }' file

• gsub(...)- gsub()Funkcja zwraca liczbę dokonanych podstawień.

Wyjście:

1
1
1
0
1
2
2

Inne awkpodejście (zwróci -1 dla pustych linii).

awk -F'[^N ]' '$0=NF-1""' infile

Lub w postaci złożonej zwróci -1 w pustych wierszach, 0 tylko w wierszach z białymi spacjami (tabulatory / spacje).

awk -F'[^N \t]+' '$0=NF-1""' infile

1. tri skrypt powłoki POSIX :

   tr -d 'N ' < file | while read x ; do echo ${#x} ; done
   

2. bash, kshi zsh:

   while read x ; do x="${x//[ N]}" ; echo ${#x} ; done < file
   

Krótka kombinacja tri awk:

$ tr -d ' N' <file.in | awk '{ print length }'
1
1
1
0
1
2
2

To usuwa wszystkie spacje i Ns z pliku wejściowego i awkpo prostu drukuje długość każdej linii.

Innym łatwym sposobem jest zrobienie tego w Pythonie, który jest wstępnie zainstalowany w większości środowisk unixowych. Upuść następujący kod w pliku .py:

with open('geno') as f:
    for line in f:
        count = 0
        for word in line.split():
            if word != 'N':
                count += 1
        print(count)

A następnie wykonaj:

python file.py

Z twojego terminala. Powyższe powoduje:

• dla każdej linii w pliku o nazwie „geno”
• ustaw licznik na 0 i zwiększaj go za każdym razem, gdy znajdziemy wartość! = 'N'
• po osiągnięciu końca bieżącej linii wydrukuj licznik i przejdź do następnej linii