Moje pytanie dotyczy tych, którzy zajmują się algorytmami biologii obliczeniowej. Mam zamiar wziąć udział w kursie z bioinformatyki tej jesieni; Problemem jest jednak to, że mam zbyt małe doświadczenie w biologii i chemii, aby czuć się przygotowanym na ten cykl wykładów (byłem raczej słaby na te przedmioty w szkole).
Czy mógłbyś polecić jakieś książki, które byłyby dobrym wstępem do zagadnień nauk przyrodniczych, na których koncentruje się bioinformatyka?
algorithms
reference-request
education
bioinformatics
Michaił Dubow
źródło
źródło
Odpowiedzi:
Jak stwierdzono w poprzedniej odpowiedzi, nie jest absolutnym wymogiem studiowanie biologii w celu wykonywania bioinformatyki. Jeśli jednak chcesz mieć podstawowe zrozumienie podstawowych pojęć, takich jak geny, RNA, DNA itp., Dobra książka wprowadzająca do biologii powinna zapewnić wszystko, czego potrzebujesz.
Biologia molekularna nie jest jednak tematem, który można po prostu zanurzyć w środku. Dlatego, aby to zrozumieć, musisz zrobić wstępną lekturę. Najlepsza książka to taka, która zawiera wystarczająco dużo szczegółów, nie zakładając, że chcesz zostać biologiem.
Sugeruję, aby spojrzeć na Collins Outline of College Biology. Czytanie rozdziałów 2-5 i 12-15 powinno dostarczyć podstawowych informacji, których pragniesz. Innym wyborem jest Zarys biologii Schauma, wydanie trzecie, rozdziały 2-4 i 7-10. Obie książki kosztują mniej niż 20,00 USD i są łatwe do zrozumienia. Mam nadzieję że to pomoże.
źródło
Jako osoba wywodząca się z informatyki i kierująca zespołem opracowującym produkt obejmujący bioinformatykę, mogę współczuć wyzwaniu, jakim jest wybranie domeny - ale jest to fascynujący obszar do pracy.
Jak zauważył @JCEHR, nie jest absolutnym wymogiem studiowanie biologii, ale pomocne jest rozpoczęcie zbierania niektórych zasad. Bioinformatyka to nie tylko biologia molekularna, sekwencjonowanie genomowe, ekspresja białek i struktura białek (nie martw się, jeśli nie rozumiesz teraz tych terminów), ale jestem całkiem pewny, że jest to obszar, w którym zdecydowana większość „tradycyjnej bioinformatyki” jest stosowany i byłby podstawą każdego kursu na ten temat. Jedną z najważniejszych mierzalnych cech DNA, RNA i białka jest to, że są one ciągiem molekuł, które mogą być reprezentowane przez ciąg programowy - adnotacje, przechowywanie i (rozmyte) wyszukiwanie tych ciągów to kluczowe techniki.
Oprócz ogólnego podkładu do biologii można również rozważyć książkę poświęconą genomice. Poniższe wygląda dobrze, ale jest trochę drogie:
Primer of Genome Science , Greg Gibson i Spencer V. Muse
źródło
Jako informatyk, który ukończył studia biochemiczne, zalecam, aby Larry Gonick's Cartoon guide to Genetics .
To nie jest żart. Znam kilku szanowanych bioinformatyków, którzy w ten sposób nauczyli się genetyki. Książka wyjaśnia większość tego, o ile nie wszystko, musisz wiedzieć i zapewnia najbardziej intuicyjne wizualizacje, aby skupić się wokół podstawowych koncepcji. I to jest fajna lektura.
źródło
Jak powiedzieli ci inni: to zależy trochę od książki, której będziesz używać, a także od nauczanych tematów. Czasami będzie to raczej oczywiste. Jednak, aby być lepiej przygotowanym (i przyzwyczaić się do terminologii), spójrz na niektóre startery w sieci, takie jak Preparata: A Biology Primer for Computer Scientists .
Czy mamy kolegów, czy strona „biostar” jest przyjaznym klonem? Zobacz pytanie: „ Najlepsze zasoby do nauki biologii molekularnej dla informatyka ”.
źródło