Pracuję nad zachowaniem znakowania u żywych zwierząt w grupie i jestem zainteresowany tym, jak pewne cechy sąsiadujących grup wpływają na zachowanie znakowania. Narysowałem terytoria każdej grupy na podstawie izopletów o gęstości 95% utworzonych przy użyciu a-LoCoH. Znaki każdej osoby z grupy są wykreślane jako osobna warstwa punktów. Oznaczanie nie wydaje się losowe i wydają się skupiać wokół granic z sąsiednimi grupami. Co chciałbym zbadać, czy osoby zaznaczają więcej w pobliżu niektórych grup niż w pobliżu innych, na przykład, czy osoby zaznaczają mniej w pobliżu grup, które są blisko spokrewnione? czy można pokazać, że punkty skupiają się w pobliżu niektórych obiektów, ale nie w pobliżu innych?
Każda pomoc, która może być udzielona, byłaby bardzo wdzięczna,
Dave Humphries
##### aktualizacjaDla celów demonstracyjnych poniżej znajduje się obraz czterech terytoriów (A, B, C i D) oraz lokalizacje oznaczania dwóch osobników z grupy A. Grupy A i B są ze sobą ściśle powiązane. Grupy C i D nie są powiązane z grupą A.
źródło
Odpowiedzi:
Zdecydowanie polecam przyjrzeć się R , w szczególności pakietowi spatstat z CSRIO. Dostępny jest doskonały podręcznik / samouczek autorstwa prof. Adriana Baddeleya, który przeprowadzi cię przez wiele różnych metod analizy wzoru punktowego. Szczególnie rzuciłbym okiem na Część VII: Wzory Marked Point (szczególnie funkcja korelacji Mark na stronie 202). Uwaga: oznaczenia tutaj odnoszą się do danych klasyfikowanych według atrybutu zamiast relacji numerycznych.
Na początku dokumentu znajduje się również rozdział dotyczący odczytu danych (przy użyciu rgdal , sp itp.). Jeśli używasz ArcGIS, przyjrzałbym się środowisku modelowania geoprzestrzennego jako jeden ze sposobów łączenia danych w R i ArcGIS, w przeciwnym razie QGIS będzie zarządzałR, który zrobiłby to samo.
Wreszcie @whuber (między innymi) tutaj w GIS SE ma ogromną ilość doświadczenia w R, więc zadawaj pytania, gdy je znajdziesz lub spróbuj złapać go na czacie.
źródło