animowana mapa w R.

wszystkim przepraszam, że przeszkadzam, ale jestem całkiem nowy, ponieważ stanąłem przed kluczową trudnością: chcę stworzyć animowaną mapę Russina ze zmianami bezrobocia w różnych latach. Na zdjęciu widać dane z jednego roku

require(sp)
require(maptools)

require(RColorBrewer)
require(rgdal)
 rus<-url("http://www.filefactory.com/file/4h1hb5c1cw7r/n/RUS_adm1_RData")
print(load(rus))


unempl <- read.delim2(file="C:\\unempl1.txt", header = TRUE, 
        sep = ";",quote = "", dec=",", stringsAsFactors=F)

gadm_names <-gadm$NAME_1
total <- length(gadm_names)
pb <- txtProgressBar(min = 0, max = total, style = 3) 

order <- vector()
for (i in 1:total){  

  order[i] <- agrep(gadm_names[i], unempl$region, 
                     max.distance = 0.2)[1]
 setTxtProgressBar(pb, i)               # update progress bar
}


col_no <- as.factor(as.numeric(cut(unempl$data[order],
                    c(0,2.5,5,7.5,10,15,100))))


levels(col_no) <- c("<2,5%", "2,5-5%", "5-7,5%",
                    "7,5-10%", "10-15%", ">15%")


gadm$col_no <- col_no
myPalette<-brewer.pal(6,"Purples")



proj4.str <- CRS("+init=epsg:3413 +lon_0=105")
gadm.prj <- spTransform(gadm, proj4.str)

spplot(gadm.prj, "col_no", col=grey(.9), col.regions=myPalette,
main="Unemployment in Russia by region")

Rezultat, który chcę uzyskać, przypomina coś w rodzaju animacji tutaj: http://spatial.ly/2011/02/mapping-londons-population-change-2011-2030/ Jednak często googlowałem, czytałem wiele tematów w http://stackoverflow.com, w tym: Tworzenie filmu z serii fabuł w R , ale nadal nie można zrobić właściwej rzeczy.

z góry dziękuję!

Wymyśliłem coś takiego: czy ktoś może mi powiedzieć, gdzie jest błąd:

require(animation)
    require(sp)
    require(RColorBrewer) 
    require(classInt)     
require(rgdal)
 rus<-url("http://www.filefactory.com/file/4h1hb5c1cw7r/n/RUS_adm1_RData")
print(load(rus))




unempl1 <- read.delim2(file="C:\\unempl11.txt", header = TRUE, 
        sep = ";",quote = "", dec=",", stringsAsFactors=F)
unempl2<- read.delim2(file="C:\\unempl12.txt", header = TRUE, 
        sep = ";",quote = "", dec=",", stringsAsFactors=F)

gadm_names <-gadm$NAME_1


total <- length(gadm_names)
pb <- txtProgressBar(min = 0, max = total, style = 3) 

order <- vector()

for (i in 1:total){  

  order[i] <- agrep(gadm_names[i], unempl1$region, 
                     max.distance = 0.2)[1]
 setTxtProgressBar(pb, i)               # update progress bar
}


for (l in 1:total){  

  order[l] <- agrep(gadm_names[l], unempl2$region, 
                     max.distance = 0.2)[1]
 setTxtProgressBar(pb, i)               # update progress bar
}

col_no_1 <- as.factor(as.numeric(cut(unempl1$data[order],
                    c(0,2.5,5,7.5,10,15,100))))

col_no_2<- as.factor(as.numeric(cut(unempl2$data[order],
                    c(0,2.5,5,7.5,10,15,100))))
saveHTML(
      for(k in 1:2) {
        try<-get(paste("col_no_", k, sep = ""))

levels(try) <- c("<2,5%", "2,5-5%", "5-7,5%",
                    "7,5-10%", "10-15%", ">15%")


gadm$col_no <- try

myPalette<-brewer.pal(6,"Purples")



proj4.str <- CRS("+init=epsg:3413 +lon_0=105")
gadm.prj <- spTransform(gadm, proj4.str)

spplot(gadm.prj, "col_no", col=grey(.9), col.regions=myPalette,
main="Unemployment in Russia by region")
},img.name = "map", htmlfile = "unrus2.html")

Oto dane umożliwiające odtworzenie kodu

To jest tak daleko, jak tylko mogę. Powinieneś być w stanie to rozgryźć na podstawie tego kodu. Ponownie, ponieważ twój problem nie jest powtarzalny, musiałem stworzyć fikcyjne dane, aby zilustrować rozwiązanie. Jednym z dziwnych aspektów korzystania ze spplotu jest to, że ponieważ używa on siatki do utworzenia wykresu, musisz utworzyć obiekt, a następnie wydrukować obiekt. W przeciwnym razie nie otrzymasz fabuły.

require(animation)
require(sp)
require(RColorBrewer) 
require(classInt)     
require(rgdal)

load(url("http://www.filefactory.com/file/4h1hb5c1cw7r/n/RUS_adm1_RData"))
closeAllConnections()

# Set color palette
myPalette <- brewer.pal(6,"Purples")

# Reproject data
gadm <- spTransform(gadm, CRS("+init=epsg:3413 +lon_0=105"))

# Create dummy unployment data with 10% change in gadm object 
gadm@data$uemp2000 <- runif(dim(gadm)[1],0,50)
gadm@data$uemp2001 <- gadm@data$uemp2000 + (gadm@data$uemp2000 * 0.10) 
gadm@data$uemp2002 <- gadm@data$uemp2001 + (gadm@data$uemp2001 * 0.10) 
gadm@data$uemp2003 <- gadm@data$uemp2002 + (gadm@data$uemp2002 * 0.10) 
gadm@data$uemp2004 <- gadm@data$uemp2003 + (gadm@data$uemp2003 * 0.10) 
gadm@data$uemp2005 <- gadm@data$uemp2004 + (gadm@data$uemp2004 * 0.10) 

# Coerce into factors with defined levels
for( i in c("uemp2000","uemp2001","uemp2002","uemp2003","uemp2004","uemp2005") ) {
  gadm@data[,i] <- as.factor(as.numeric(cut(gadm@data[,i], 
                             c(0,2.5,5,7.5,10,15,100)))) 
    levels(gadm@data[,i]) <- c("<2,5%", "2,5-5%", "5-7,5%",
                               "7,5-10%", "10-15%", ">15%")                          
    } 

saveHTML(
  for(i in c("uemp2000","uemp2001","uemp2002","uemp2003","uemp2004","uemp2005")) {
    sp.plot <- spplot(gadm, i, col=grey(.9), col.regions=myPalette,
                      main=paste("Unemployment in Russia", i, sep=" - ") )
      print( sp.plot )
},img.name = "map", htmlfile = "unrus2.html")

Spójrz na pakiet animacji . Jedną z funkcji wartych poznania, która nie wymaga oprogramowania innych firm, jest „saveHTML”.

Korzystanie z funkcji „saveHTML” w pakiecie animacji jest bardzo proste. Oto przykładowy kod, w którym tworzę animację losowej zmiany populacji. Argument „expr” definiuje funkcję drukowania, którą chcesz przekazać do animacji. Jak widać w poniższym kodzie, użyłem pętli for do wykreślenia każdej symulowanej kolumny.

    require(animation)
    require(sp)
    require(RColorBrewer) 
    require(classInt)     

# Load your data and add random population change column
    load(url("http://www.gadm.org/data/rda/GBR_adm2.RData"))
      for( i in 1:10 ) {
        gadm@data[paste("Year",i, sep="")] <- runif(dim(gadm)[1],0,1) 
       }

# Create HTML animation using for loop for each simulated column    
    saveHTML(
      for(x in names(gadm@data)[19:28]) { 
      ani.options(interval = 0.5)  
       plotvar <- gadm@data[,x]
          nclr <- 9
         plotclr <- rev(brewer.pal(nclr,"BuPu"))
          cuts <- classIntervals(plotvar, style="fixed", 
               fixedBreaks=c(0,0.1,0.2,0.3,0.4,0.5,0.6,0.7,0.8,1))
               colcode <- findColours(cuts, plotclr)
          plot(gadm, col=colcode, border=NA, ylim=c(bbox(gadm)[,1][2], bbox(gadm)[,2][2]),
            xlim=c(bbox(gadm)[,1][1], bbox(gadm)[,2][1]))
            text(min(bbox(gadm)[1]), min(bbox(gadm)[2]), paste("Population Change",x,sep=" "))
          box()
        legend("topleft", legend=c("0-10%","10-20%","20-30%","30-40%","40-50%",
               "50-60%","60-70%","70-80%","80-100%"),
                 fill=attr(colcode, "palette"), cex=0.6, bty="n")   
        ani.pause() 
        },
           img.name="RandPopChange", htmlfile="SimPopChange.html",
           single.opts = "'controls': ['first', 'previous', 'play', 'next', 'last', 'loop', 'speed'], 'delayMin': 0",      
            description=c("Random population change:"))  

Zredagowałem post, aby podać bardziej odpowiedni przykład oparty na kolumnach wielokąta.

Animacja, którą połączyłeś (poniżej), jest animowanym obrazem GIF .

Zasadniczo jest to seria obrazów, które są cyklicznie przewijane, co tworzy efekt animacji. Pomyśl o tym, jak klikanie serii slajdów, co sekundę lub mniej więcej.

Aby utworzyć animację, musisz:

1) Utwórz każdą „ramkę”, która będzie wyświetlana.

2) Utwórz sam GIF. Istnieje kilka stron internetowych, które zrobią to za Ciebie:

http://www.createagif.net/

http://makeagif.com/

Większość tych stron pozwala kontrolować rozmiar i szybkość animacji.

StackOverflow pytanie ty związana powinien zapewnić Ci wszystko, co musisz wiedzieć, aby wykonać to zadanie w R. Zauważ, że należy najpierw zainstalować 3rd paczka party.

EDYCJA : Poniżej znajduje się zaktualizowana wersja kodu z linku StackOverflow powyżej, ponieważ wydaje się, że jest trochę zamieszania.

jpeg("/tmp/foo%02d.jpg")
for (i in 1:5) {
  my.plot(i)
}      
make.mov <- function(){
     unlink("plot.mpg")
     system("convert -delay 0.5 plot*.jpg plot.mpg")
}

dev.off()

Powyższy kod pobiera poszczególne wykresy utworzone w R i przekształca je w animację, zapętlając każdy z nich i używając programu ImageMagick , który musisz zainstalować.

Oto odpowiedź, dzięki Oscarowi Perpiñánowi.

library(sp)
library(rgdal)
library(spacetime)
library(animation)
rus <- url("http://www.filefactory.com/file/4h1hb5c1cw7r/n/RUS_adm1_RData")
load(rus)
proj4.str <- CRS("+init=epsg:3413 +lon_0=105")
gadm.prj <- spTransform(gadm, proj4.str)
N <- nrow(gadm.prj)
pols <- geometry(gadm.prj)
nms<-gadm$NAME_1
vals1  <- read.csv2("C:\\unempl11.txt")
ord1 <- match(nms, vals1$region)
vals1 <- vals1[ord1,]

vals2 <- read.csv2("C:\\unempl12.txt")
ord2 <- match(nms, vals2$region)
vals2 <- vals2[ord2,]

nDays <- 2
tt <- seq(as.Date('2011-01-01'), by='year', length=nDays)
vals <- data.frame(unempl=rbind(vals1, vals2)[,-1])

gadmST <- STFDF(pols, time=tt, data=vals)



stplot(gadmST, animate=1, do.repeat=FALSE)

saveHTML(stplot(gadmST, animate=1, do.repeat=FALSE)
, img.name = "unemplan",  htmlfile = "unan.html")