Znajdź indeks całkowity wierszy z NaN w ramce danych pandy

96

Mam takie pandy DataFrame:

                    a         b
2011-01-01 00:00:00 1.883381  -0.416629
2011-01-01 01:00:00 0.149948  -1.782170
2011-01-01 02:00:00 -0.407604 0.314168
2011-01-01 03:00:00 1.452354  NaN
2011-01-01 04:00:00 -1.224869 -0.947457
2011-01-01 05:00:00 0.498326  0.070416
2011-01-01 06:00:00 0.401665  NaN
2011-01-01 07:00:00 -0.019766 0.533641
2011-01-01 08:00:00 -1.101303 -1.408561
2011-01-01 09:00:00 1.671795  -0.764629

Czy istnieje skuteczny sposób na znalezienie „całkowitego” indeksu wierszy z NaN? W takim przypadku pożądane wyjście powinno być [3, 6].

Jean-François Corbett
źródło
12
Jeśli chcesz tylko zaznaczyć wiersze z nan, możesz to zrobićdf[np.isnan(df['b'])]
lazy1
4
Kontynuacja @ lazy1 - zamiast używać numpy's isnan, możesz również użyćdf['b'].isnull()
jmetz

Odpowiedzi:

48

Dla DataFrame df:

import numpy as np
index = df['b'].index[df['b'].apply(np.isnan)]

zwróci Ci dane MultiIndex, których możesz użyć do indeksowania z powrotem df, np .:

df['a'].ix[index[0]]
>>> 1.452354

Dla indeksu liczb całkowitych:

df_index = df.index.values.tolist()
[df_index.index(i) for i in index]
>>> [3, 6]
diliop
źródło
1
Tak intuicyjny, jak ixbrzmi, z pewnych powodów brzmi, jakby został wycofany na korzyśćiloc
kardamon
145

Oto prostsze rozwiązanie:

inds = pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]

In [9]: df
Out[9]: 
          0         1
0  0.450319  0.062595
1 -0.673058  0.156073
2 -0.871179 -0.118575
3  0.594188       NaN
4 -1.017903 -0.484744
5  0.860375  0.239265
6 -0.640070       NaN
7 -0.535802  1.632932
8  0.876523 -0.153634
9 -0.686914  0.131185

In [10]: pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]
Out[10]: array([3, 6])
Wes McKinney
źródło
29
Skończyło się na tym, że np.where(df['b'].notnull())[0]
dzięki, .nonzero()[0]jest lepsze niż [i for i, k in enumerate(mask) if k].)
Winand
2
Prawdopodobnie mógłbyś to jeszcze uprościć:r, _ = np.where(df.isna())
cs95
2
dodaj .to_numpy()najpierw do konwersji w tablicy numpy -pd.isnull(df).any(1).to_numpy().nonzero()
7bStan
14

Rozwiązanie jednoprzewodowe. Jednak działa tylko dla jednej kolumny.

df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index
Wasyl Waskiwskij
źródło
To jest to, czego szukałem. Zrobiłem to na listę, zawijając ją w list(...)taki sposób:list(df.loc[pandas.isna(df["b"]), :].index)
Daniel Butler
10

I na wszelki wypadek, jeśli zamiast tego chcesz znaleźć współrzędne „nan” dla wszystkich kolumn (zakładając, że wszystkie są liczbami), proszę bardzo:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

df
   0  1  2    3    4  5
0  0  1  3  4.0  NaN  2
1  3  5  6  NaN  3.0  3

np.where(np.asanyarray(np.isnan(df)))
(array([0, 1]), array([4, 3]))
Filippo Mazza
źródło
9

Nie wiem, czy jest już za późno, ale możesz użyć np.where, aby znaleźć indeksy innych niż wartości jako takie:

indices = list(np.where(df['b'].isna()[0]))
naturesenshi
źródło
4

w przypadku, gdy masz indeks datetime i chcesz mieć wartości:

df.loc[pd.isnull(df).any(1), :].index.values
Amirkhm
źródło
4

Oto testy kilku metod:

%timeit np.where(np.isnan(df['b']))[0]
%timeit pd.isnull(df['b']).nonzero()[0]
%timeit np.where(df['b'].isna())[0]
%timeit df.loc[pd.isna(df['b']), :].index

I odpowiadające im czasy:

333 µs ± 9.95 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
280 µs ± 220 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
313 µs ± 128 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
6.84 ms ± 1.59 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

Wydawałoby się, że pd.isnull(df['DRGWeight']).nonzero()[0]wygrywa dzień pod względem czasu, ale każda z trzech najlepszych metod ma porównywalną wydajność.

Adam Erickson
źródło
2

Innym prostym rozwiązaniem jest list(np.where(df['b'].isnull())[0])

karthikeyan
źródło
1

Oto kolejne prostsze podejście:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

inds = np.asarray(df.isnull()).nonzero()

(array([0, 1], dtype=int64), array([4, 3], dtype=int64))
wosk pszczeli nonya
źródło
1

Szukałem wszystkich indeksów wierszy z wartościami NaN.
Moje rozwiązanie robocze:

def get_nan_indexes(data_frame):
    indexes = []
    print(data_frame)
    for column in data_frame:
        index = data_frame[column].index[data_frame[column].apply(np.isnan)]
        if len(index):
            indexes.append(index[0])
    df_index = data_frame.index.values.tolist()
    return [df_index.index(i) for i in set(indexes)]
murthy10
źródło
0

Niech ramka danych zostanie nazwana df, a interesująca nas kolumna (tj . Kolumna, w której próbujemy znaleźć wartości null ) to „b” . Następnie poniższy fragment kodu podaje żądany indeks o wartości null w ramce danych:

   for i in range(df.shape[0]):
       if df['b'].isnull().iloc[i]:
           print(i)
Stone Austin
źródło