tf.data.Dataset: Argument `batch_size` nie może być określony dla danego typu danych wejściowych

10

Korzystam z Talos i Google colab TPU, aby uruchomić dostrajanie hiperparametrów modelu Keras . Zauważ, że używam Tensorflow 1.15.0 i Keras 2.2.4-tf.

import os
import tensorflow as tf
import talos as ta
from tensorflow.keras.models import Sequential
from tensorflow.keras.layers import Dense
from tensorflow.keras.optimizers import Adam
from sklearn.model_selection import train_test_split

def iris_model(x_train, y_train, x_val, y_val, params):

    # Specify a distributed strategy to use TPU
    resolver = tf.contrib.cluster_resolver.TPUClusterResolver(tpu='grpc://' + os.environ['COLAB_TPU_ADDR'])
    tf.contrib.distribute.initialize_tpu_system(resolver)
    strategy = tf.contrib.distribute.TPUStrategy(resolver)

    # Use the strategy to create and compile a Keras model
    with strategy.scope():
      model = Sequential()
      model.add(Dense(32, input_shape=(4,), activation=tf.nn.relu, name="relu"))
      model.add(Dense(3, activation=tf.nn.softmax, name="softmax"))
      model.compile(optimizer=Adam(learning_rate=0.1), loss=params['losses'])

    # Convert data type to use TPU
    x_train = x_train.astype('float32')
    x_val = x_val.astype('float32')

    dataset = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((x_train, y_train))
    dataset = dataset.cache()
    dataset = dataset.shuffle(1000, reshuffle_each_iteration=True).repeat()
    dataset = dataset.batch(params['batch_size'], drop_remainder=True)

    # Fit the Keras model on the dataset
    out = model.fit(dataset, batch_size=params['batch_size'], epochs=params['epochs'], validation_data=[x_val, y_val], verbose=0, steps_per_epoch=2)

    return out, model

# Load dataset
X, y = ta.templates.datasets.iris()

# Train and test set
x_train, x_val, y_train, y_val = train_test_split(X, y, test_size=0.30, shuffle=False)

# Create a hyperparameter distributions 
p = {'losses': ['logcosh'], 'batch_size': [128, 256, 384, 512, 1024], 'epochs': [10, 20]}

# Use Talos to scan the best hyperparameters of the Keras model
scan_object = ta.Scan(x_train, y_train, params=p, model=iris_model, experiment_name='test', x_val=x_val, y_val=y_val, fraction_limit=0.1)

Po przekonwertowaniu zestawu pociągów na zestaw danych przy użyciu pojawia tf.data.Datasetsię następujący błąd podczas dopasowywania modelu out = model.fit:

---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-3-c812209b95d0> in <module>()
      8 
      9 # Use Talos to scan the best hyperparameters of the Keras model
---> 10 scan_object = ta.Scan(x_train, y_train, params=p, model=iris_model, experiment_name='test', x_val=x_val, y_val=y_val, fraction_limit=0.1)

8 frames
/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow_core/python/keras/engine/training.py in _validate_or_infer_batch_size(self, batch_size, steps, x)
   1813             'The `batch_size` argument must not be specified for the given '
   1814             'input type. Received input: {}, batch_size: {}'.format(
-> 1815                 x, batch_size))
   1816       return
   1817 

ValueError: The `batch_size` argument must not be specified for the given input type. Received input: <DatasetV1Adapter shapes: ((512, 4), (512, 3)), types: (tf.float32, tf.float32)>, batch_size: 512

Następnie, jeśli wykonam te instrukcje i nie ustawię argumentu wielkości partii na model.fit. Otrzymuję kolejny błąd w:

---------------------------------------------------------------------------
TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-3-c812209b95d0> in <module>()
      8 
      9 # Use Talos to scan the best hyperparameters of the Keras model
---> 10 scan_object = ta.Scan(x_train, y_train, params=p, model=iris_model, experiment_name='test', x_val=x_val, y_val=y_val, fraction_limit=0.1)

8 frames
/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow_core/python/keras/engine/training.py in _distribution_standardize_user_data(self, x, y, sample_weight, class_weight, batch_size, validation_split, shuffle, epochs, allow_partial_batch)
   2307             strategy) and not drop_remainder:
   2308           dataset_size = first_x_value.shape[0]
-> 2309           if dataset_size % batch_size == 0:
   2310             drop_remainder = True
   2311 

TypeError: unsupported operand type(s) for %: 'int' and 'NoneType'
Sami Belkacem
źródło
Byłoby pomocne dla tego ostatniego błędu, gdybyś mógł opublikować ślad całego stosu, ponieważ ta funkcja wydaje się być wywoływana w wielu miejscach w tym pliku, więc nie mogę powiedzieć, gdzie jesteś: github.com/tensorflow/tensorflow /blob/r1.15/tensorflow/python/…
mdaoust
Właśnie edytowałem pytanie, możesz sprawdzić ślad stosu, dziękuję za poświęcony czas i uwagę.
Sami Belkacem

Odpowiedzi:

0

z kodu github :

ValueError zostanie podniesiony, jeśli xjest generatorem lub Sequenceinstancją i batch_sizejest określony, ponieważ oczekujemy, że użytkownicy dostarczą partie zestawów danych.

Spróbuj użyć batch_size = None

Ioannis Nasios
źródło
Otrzymuję kolejny błąd w _distribution_standardize_user_data (self, x, y, sample_weight, class_weight, batch_size, validation_split, shuffle, epochs, allow_partial_batch) TypeError: nieobsługiwane typy operandów dla *: „NoneType” i „int
Sami Belkacem
powinieneś także ustawić steps_per_epoch = None
Ioannis Nasios
To nie działa, pojawia się kolejny błąd: Błąd: Próba konwersji wartości (Brak) z nieobsługiwanym typem (<klasa „NoneType”>) na Tensor. Myślę, że można łatwo odtworzyć błąd, kopiując krótki program
Sami Belkacem,
0

Nie jestem pewien, czy poniższe będą pasować do rachunku, ale warto spróbować. Wszystko, co zrobiłem, jest zdjęte z repeat () z zestawu danych i batch_size = params ['batch_size'] z modelu.fit

Jeśli powyższe nie jest tym, co jesteś gotowy poświęcić, zignoruj ​​post.

import os
import tensorflow as tf
import talos as ta
from tensorflow.keras.models import Sequential
from tensorflow.keras.layers import Dense

def iris_model(x_train, y_train, x_val, y_val, params):

    # Specify a distributed strategy to use TPU
    resolver = tf.distribute.cluster_resolver.TPUClusterResolver(tpu='grpc://' + os.environ['COLAB_TPU_ADDR'])
    tf.config.experimental_connect_to_host(resolver.master())
    tf.tpu.experimental.initialize_tpu_system(resolver)
    strategy = tf.distribute.experimental.TPUStrategy(resolver)

    with strategy.scope():
        model = Sequential()
        model.add(Dense(32, input_dim=4, activation=params['activation']))
        model.add(Dense(3, activation='softmax'))
        model.compile(optimizer=params['optimizer'], loss=params['losses'])

    # Convert the train set to a Dataset to use TPU
    dataset = tf.data.Dataset.from_tensor_slices((x_train, y_train))
    dataset = dataset.cache().shuffle(1000, reshuffle_each_iteration=True).batch(params['batch_size'], drop_remainder=True)

    out = model.fit(dataset, epochs=params['epochs'], validation_data=[x_val, y_val], verbose=0)

    return out, model

x, y = ta.templates.datasets.iris()

p = {'activation': ['relu', 'elu'],
       'optimizer': ['Nadam', 'Adam'],
       'losses': ['logcosh'],
       'batch_size': (20, 50, 5),
       'epochs': [10, 20]}

scan_object = ta.Scan(x, y, model=iris_model, params=p, fraction_limit=0.1, experiment_name='first_test')
Amit
źródło
Nie działa: TypeError: nieobsługiwane typy operandów dla *: „NoneType” i „int”
Sami Belkacem,
0

Ten drugi błąd _distribution_standardize_user_datapojawia się, gdy nie spełniasz batch_sizewymagań.

Kod, który uruchamiasz dla tej funkcji, znajduje się tutaj:

https://github.com/tensorflow/tensorflow/blob/r1.15/tensorflow/python/keras/engine/training.py#L2192

Nie opublikowałeś śledzenia wstecznego, ale założę się, że nie działa on na linii 2294 , ponieważ jest to jedyne miejsce, w którym batch_sizecoś się pomnaża.

if shuffle:
          # We want a buffer size that is larger than the batch size provided by
          # the user and provides sufficient randomness. Note that larger
          # numbers introduce more memory usage based on the size of each
          # sample.
          ds = ds.shuffle(max(1024, batch_size * 8))

Wygląda na to, że możesz go wyłączyć, ustawiając shuffle=False.

fit(ds, shuffle=False,...)

Czy to działa?

mdaoust
źródło
Dzięki, ale wciąż pojawia się ten sam błąd z shuffle = False. Nie działa na linii 2309, a nie 2294.
Sami Belkacem
@SamiBelkacem, że '
mdaoust
0

Czy możesz usunąć te wiersze ze swojego kodu i spróbować:

    dataset = dataset.cache()
    dataset = dataset.shuffle(1000, reshuffle_each_iteration=True).repeat()
    dataset = dataset.batch(params['batch_size'], drop_remainder=True)
WITH THESE:
    dataset = dataset.repeat()
    dataset = dataset.batch(128, drop_remainder=True)
    dataset = dataset.prefetch(1)

W przeciwnym razie to, co napisałeś, tf.data.Dataset.from_tensor_slicesma coś wspólnego z błędem.

Rishabh Sahrawat
źródło
Wciąż nie działa. Jak powiedziałeś, tf.data.Dataset ma coś wspólnego z błędem. Ale dokumentacja mówi, że konieczne jest uwzględnienie go podczas korzystania z chmury TPU tensorflow.org/guide/tpu#input_datasets
Sami Belkacem