Pomysły na oprogramowanie „laboratoryjne”?

20

Jest to więc dziwne dopasowanie, choć naprawdę myślę, że jest dziwne dla każdej strony, więc pomyślałem, że wypróbuję to tutaj, wśród moich braci, którzy mają problemy z danymi.

Przyszłam do epidemiologii i biostatystyki z biologii i nadal zdecydowanie mam pewne nawyki z tej dziedziny. Jednym z nich jest prowadzenie zeszytu laboratoryjnego. Przydaje się to do dokumentowania myśli, decyzji, rozważań na temat analizy itp. Wszystko w jednym miejscu, wszystko zaangażowane, dzięki czemu mogę później spojrzeć na analizę i dowiedzieć się, co zrobiłem.

Ale byłoby miło przenieść to w XXI wiek. W szczególności dlatego, że chociaż system notebooków laboratoryjnych jest wystarczająco przyzwoity dla jednej osoby i dokumentowania decyzji, fajnie byłoby móc dołączyć wykresy z EDA, e-maile od menedżerów danych omawiających konkretny zestaw danych itp.

Domyślam się, że będzie to wiązało się z przygotowaniem własnego systemu z nieświętego połączenia wielu różnych bitów, ale czy ktoś obecnie używa systemu i ma jakieś zalecenia?

Fomite
źródło
1
Myślę, że może być OK dziadkowi (tzn. Pozostawić otwarty) ten wątek.
Gung - Przywróć Monikę

Odpowiedzi:

10

Są to tak zwane Electronic Lab Notebooks (ELN).

Oto niektóre z opcji open source, na które patrzyłem:

  1. The Sage Notebook .

  2. Nowy notatnik IPython , który można teraz uruchomić jako aplikację internetową na EC2 i platformie Azure.

  3. Leo, którego można używać z IPython i na wiele innych sposobów.

  4. Różne rozwiązania wiki, blogów i CMS.

Ed Hagen
źródło
Skończyło się na tym, że użyłem darmowej wiki Wikispaces jako mojego obecnego eksperymentalnego notatnika laboratoryjnego.
Fomite
10

Moje ulubione: Evernote . Możesz oznaczać wpisy (np. „Analiza”, „pomysł” itp.), Wklejać zdjęcia i grafikę oraz udostępniać notesy współpracownikom. I: jest w zasadzie darmowy (no cóż, freemium). Ale darmowa edycja jest dla mnie absolutnie wystarczająca.

Felix S.
źródło
Ponadto istnieją bezpłatne aplikacje na Androida i iOS.
Jose Zubcoff,
+1 Uważam, że aplikacja mobilna dla Evernote jest szczególnie przydatna podczas biegania między laboratoriami lub zapisywania myśli z dala od komputera.
jthetzel
2

Nigdy nie korzystałem z niego osobiście, ale Microsoft ma w pakiecie Office oprogramowanie o nazwie OneNote, które realizuje cel podobny do specyfikacji notebooków e-lab. Więcej informacji można znaleźć na ich stronie internetowej . Oferują również bezpłatną wersję próbną w pakiecie z MS Office tutaj .

Christopher Aden
źródło
1
@mbq, czy znalazłeś przyzwoity zamiennik Linuksa dla Onenote?
andreas-h
2

Uznałem, że Xmind jest użyteczny. Możesz dołączyć wszystko, a struktura drzewa jest naprawdę przydatna do organizowania. Szczególnie podoba mi się funkcja, w której można przejść do węzła (temat). Istnieje więcej podobnych programów, które wykorzystują tę samą koncepcję.

mpiktas
źródło
2
Freeplane i Freemind to dwie bezpłatne alternatywy, których użyłem do różnych projektów. Nowym rozwidleniem FreeMind jest SciPlore MindMappings, który obejmuje obsługę referencji BibTeX i importowanie zakładek z pliku PDF.
Wayne,
2

Osobiście znalazłem Livescribe „SmartPen” zbawieniem.

Łączy zaufany „urok starego świata” tradycyjnego długopisu i papierowego notatnika, ale obejmuje również możliwość nagrywania dźwięku (który synchronizuje z pociągnięciami pióra) gotowego do późniejszej korekty. Uwaga: jest pewna wada i musisz kupić specjalny papier, który działa z piórem ..... huśtawki i rundy

Pióro / długopis wywołuje przesłanie do sieci, a następnie dołączenie do wielu innych programów, które zostały już opisane powyżej.

Studenci, których uczę (biomechanika) absolutnie to uwielbiają, a późniejsze studiowanie trudnych pojęć jest znacznie łatwiejsze niż wcześniej (pre livecribe)

Andrew V.
źródło
1

Możesz wypróbować najnowszą wersję beta Zotero , która jest teraz samodzielna i nie wymaga przeglądarki Firefox.

Wayne
źródło
1
Zotero jest menedżerem bibliografii, a nie ELN.
nico,
1
@nico: Wierzę, że możesz przechowywać w Zotero wszystko, co chcesz, w tym własne dokumenty. To nie jest dokładnie ELN, ale jest darmowy i ułatwiłby uwzględnienie (i zindeksowanie) również innych materiałów.
Wayne
jasne i wspaniale, że o tym wspomniałeś (często go używam i jest niesamowity), ale istnieją inne alternatywy typu open source, które są uważane za ELN, więc dlaczego ich nie użyć?
nico
1

Sprawdź ten artykuł, Upiększanie danych w prawdziwym świecie , z Nature Precedings, aby uzyskać kilka pomysłów.

Charlie
źródło
2
to fajny artykuł, ale pomogłoby to podsumować niektóre informacje zawarte w twojej odpowiedzi
Abe,
Cześć @ Tak, tak, to byłoby bardziej pomocne. Sam nie czytałem tego artykułu, znajdowałem go tylko wczoraj i nie byłem specjalnie zainteresowany tym tematem. Myślałem, że i tak się podzielę.
Charlie,
0

Co powiesz na Boogie Board? Możesz pisać notatki na tabliczce i zapisywać je jako taki sam pomysł jak pióro LiveScribe, ale możesz zapisać je jako pliki PDF ... Jeszcze nie ma, ale będzie za mniej niż miesiąc.

Berk U.
źródło
Onesoftwares pobrać firefox 57,0 Download.
NomanJaved