Jak modelować podłużne duże zbiory danych?

14

Tradycyjnie używamy modelu mieszanego do modelowania danych podłużnych, tj. Danych takich jak:

id obs age treatment_lvl yield
1  0   11   M  0.2
1  1   11.5 M  0.5
1  2   12   L  0.6
2  0   17   H  1.2
2  1   18   M  0.9

możemy przyjąć losowe przechwytywanie lub nachylenie dla różnych osób. Jednak pytanie, które próbuję rozwiązać, będzie obejmować ogromne zbiory danych (miliony osób, obserwacja 1 miesiąc dziennie, tj. Każda osoba będzie miała 30 obserwacji), obecnie nie wiem, czy istnieją pakiety, które mogą wykonać ten poziom danych.

Mam dostęp do Spark / Mahout, ale nie oferują one modeli mieszanych, moje pytanie brzmi: czy w każdym razie mogę zmodyfikować swoje dane, aby móc użyć RandomForest lub SVM do modelowania tego zestawu danych?

Jakieś techniki inżynierii cech, które mogę wykorzystać, aby pomóc RF / SVM w rozliczeniu autokorelacji?

Wielkie dzięki!

Niektóre potencjalne metody, ale nie mogłem pozwolić sobie na czas na napisanie ich w iskrze

Jak mogę dołączyć losowe efekty do randomForest

Regresja SVM z danymi podłużnymi

użytkownik2926523
źródło
1
zestaw danych nie jest tak duży. 1 milion podmiotów z 30 rekordami, może 20 bajtów danych na rekord przyniesie 600 MB. to nic. poradzi sobie z tym każdy pakiet statystyk
Aksakal,

Odpowiedzi:

4

Jeśli masz tylko kilka zmiennych, jak w przykładzie, nie powinieneś mieć problemu z jakimś wariantem lme4.

Techniki uczenia maszynowego naprawdę świecą, gdy masz wiele zmiennych i chcesz modelować nieliniowości i interakcje między zmiennymi. Opracowano niewiele podejść ML, które mogą to zrobić z danymi podłużnymi. RNN są jedną z opcji, chociaż są one na ogół zoptymalizowane pod kątem problemów z szeregami czasowymi, a nie danych panelu.

Zasadniczo sieć neuronowa ze sprzężeniem zwrotnym jest (uogólnionym) modelem liniowym z regresorami, które są nieliniowymi funkcjami danych wejściowych. Jeśli pochodne regresory - górna warstwa modelu przed wyjściem - są uważane za część nieparametryczną, to nic nie powstrzymuje cię przed dodaniem wraz z nim struktury parametrycznej - być może w postaci efektów losowych.

Nie zostało to jednak zaimplementowane w przypadku problemów z klasyfikacją, które zakładam, że robisz, ponieważ interesujesz się SVM jako kandydatem.

użytkownik_ogólny
źródło
2

Czy naprawdę potrzebujesz Losowych Lasów, NN itp. Do danych podłużnych? lme4jest w stanie obsłużyć miliony osób:

https://cran.r-project.org/web/packages/lme4/vignettes/Theory.pdf

Z łatwością radzi sobie z liniowymi modelami mieszanymi, a jak widać z linku, obsługuje także nieliniowe modele mieszane (choć nie spodziewałbym się, że będzie błyskawiczny również dla modeli nieliniowych).

DeltaIV
źródło