W artykule Wikipedii na temat ANOVA jest napisane
W najprostszej postaci ANOVA zapewnia statystyczny test, czy średnie kilku grup są równe, a zatem uogólnia test t na więcej niż dwie grupy.
Rozumiem to, że ANOVA jest taka sama jak test t, jeśli chodzi o porównanie dwóch grup.
Jednak w moim prostym przykładzie poniżej (w R) ANOVA i test t dają podobne, ale nieco różne wartości p. Czy ktoś może wyjaśnić, dlaczego?
x1=rnorm(100,mean=0,sd=1)
x2=rnorm(100,mean=0.5,sd=1)
y1=rnorm(100,mean=0,sd=10)
y2=rnorm(100,mean=0.5,sd=10)
t.test(x1,x2)$p.value # 0.0002695961
t.test(y1,y2)$p.value # 0.8190363
df1=as.data.frame(rbind(cbind(x=x1,type=1), cbind(x2,type=2)))
df2=as.data.frame(rbind(cbind(x=y1,type=1), cbind(y2,type=2)))
anova(lm(x~type,df1))$`Pr(>F)`[1] # 0.0002695578
anova(lm(x~type,df2))$`Pr(>F)`[1] # 0.8190279
źródło