Wiem, że to pytanie zostało zadane wcześniej: Podręcznik do badań ekologicznych, ale nie tego szukam.
To, czego szukam, to czy ktoś mógłby polecić dobrą książkę (lub odniesienie kanoniczne) na temat ekologii statystycznej? Bardzo dobrze rozumiem statystyki, więc książka mogłaby naprawdę być na każdym poziomie. Korzystałbym z tej książki, aby nauczyć się więcej o stosowaniu statystyki w ekologii niż o czymkolwiek innym, więc doceniłabym nawet książkę wprowadzającą z dobrymi / interesującymi przykładami. Poza tym moje badania koncentrują się na statystykach bayesowskich, więc książka zawierająca statystyki bayesowskie jest jeszcze lepsza!
self-study
references
ecology
użytkownik25658
źródło
źródło
Odpowiedzi:
Niektóre dobre książki, które osobiście poleciłbym to:
Hilborn & Mangel (1997) The Ecological Detective: konfrontowanie modeli z danymi . Princeton University Press.
Ten dotyczy bardziej statystyk z przykładami ekologicznymi, ale nie ma w tym nic złego. Dałoby to dobry smak jak statystyki mogłyby być stosowane w ekologii. Zanotuj datę; nie obejmie niektórych nowszych wersji ani aplikacji.
M. Henry H. Stevens (2009) Primer Ekologii R . Skoczek.
Być może zbyt podstawowy i niezbyt konkretny w żadnej przestrzeni, ale obejmuje różne tematy, których nauczalibyśmy ekologów i ilustruje teorię i modele ekologiczne kodem R.
BM Bolker (2008) modele ekologiczne i danych w R . Princeton University Press.
Kocham tę książkę. Obejmuje tematy, które znasz, biorąc pod uwagę twoje statystyki, ale stosowane w kontekście ekologicznym. Nacisk na dopasowanie modeli i optymalizację ich w oparciu o podstawowe zasady przy użyciu kodu R.
James S. Clark (2007) Modele danych ekologicznych: wprowadzenie . Princeton University Press.
Nie zniechęcaj się „wstępem” w tytule; to nic innego jak wstęp. Szeroki zasięg, dużo teorii, nacisk na dopasowanie modeli ręcznie przy użyciu podejść bayesowskich (na przykład w podręczniku R lab omówiono pisanie własnych samplerów Gibbs!)
Nie jest to książka, ale dodam to, ponieważ wyraźnie wspominasz o swoim zainteresowaniu procesami gaussowskimi. Spójrz na Integrated Nested Laplace Approximation (INLA), która ma stronę internetową . Jest to pakiet R i zawiera wiele przykładów do zabawy. Jeśli spojrzysz na często zadawane pytania , znajdziesz kilka artykułów opisujących to podejście, w szczególności:
H. Rue, S. Martino i N. Chopin. Przybliżone wnioskowanie bayesowskie dla ukrytych modeli Gaussa z wykorzystaniem zintegrowanych przybliżeń zagnieżdżonych Laplace'a (z dyskusją). Journal of Royal Statistics Society, Series B, 71 (2): 319 {392, 2009. (PDF dostępny tutaj ).
źródło
Niektóre dobre książki ekologiczne oparte na statystykach bayesowskich to:
Kery, M. 2010. Wprowadzenie do WinBUGS dla ekologów: Bayesowskie podejście do regresji, ANOVA, modele mieszane i powiązane analizy . Prasa akademicka.
Kery, M. i M. Schaub. 2011. Analiza populacji bayesowskiej przy użyciu WinBUGS: perspektywa hierarchiczna . Prasa akademicka.
Royle, JA i RM Dorazio. 2008. Modelowanie hierarchiczne i wnioskowanie w ekologii: analiza danych z populacji, metapopulacji i społeczności . Prasa akademicka
Znajduję również Zuur i in. (2009) bardzo przydatne.
Zuur, A., EN Ieno, N. Walker, AA Saveliey i GM Smith. Efekty mieszane modele i rozszerzenia w Ekologii R . Skoczek.
źródło
Jack Weiss (niech spoczywa w pokoju ) był doskonale wyszkolonym statystykiem, który również bardzo dobrze znał zasady ekologiczne / środowiskowe. Był nieocenionym konsultantem statystycznym dla naukowców zajmujących się ekologią / środowiskiem w całych Stanach Zjednoczonych, a nawet na całym świecie.
Chociaż nie ma on żadnych znanych mi książek, jego notatki z kursów są nadal dostępne online :
Metody statystyczne w ekologii [lub wersja z 2012 r. ]
Statystyka dla nauk o środowisku [lub 2007 ; Wersja 2012 ]
Statystyka ekologii i ewolucji
Ekologia 145 — Analiza statystyczna
Jestem pewien, że wiele kursów nakłada się na siebie, ale jego notatki (i kod R) są dostępne dla każdego z tych kursów i powinny okazać się bardzo przydatne dla większości osób odwiedzających ten post.
źródło