Szukałem tego pytania i jeszcze nie otrzymałem rozsądnej odpowiedzi. Jeśli zsynchronizuję folder, czy zsynchronizuje on dowiązanie symboliczne? Czy będzie przetwarzane przez cały link do wszystkich plików w tym dowiązaniu symbolicznym?

Z FAQ Ubuntu One :

Czy Ubuntu One obsługuje dowiązania symboliczne lub dowiązania twarde?

Nie, Ubuntu One nie obsługuje obecnie dowiązań symbolicznych ani dowiązań twardych. Jeśli korzystasz z systemu Ubuntu 10.04 LTS lub nowszego, możesz synchronizować foldery w katalogu domowym, klikając je prawym przyciskiem myszy i wybierając opcję „Synchronizuj w systemie Ubuntu One”.

Obejście: Możesz utworzyć twardy link w innym folderze; następnie przenieś ten nowo utworzony twardy link do folderu Ubuntu One. Próbowałem tego w terminalu i działało, więc myślę, że możesz również napisać skrypt i użyć go jako skryptu nautilus.