Instalowanie SciPy i NumPy za pomocą pip

Próbuję utworzyć wymagane biblioteki w dystrybuowanym pakiecie. Wymaga obu bibliotek SciPy i NumPy . Podczas programowania zainstalowałem oba przy użyciu

apt-get install scipy

który zainstalował SciPy 0.9.0 i NumPy 1.5.1 i działał dobrze.

Chciałbym zrobić to samo używając pip install- aby móc określić zależności w setup.py mojego własnego pakietu.

Problem w tym, że kiedy próbuję:

pip install 'numpy==1.5.1'

to działa dobrze.

Ale wtedy

pip install 'scipy==0.9.0'

zawiedzie żałośnie, z

raise self.notfounderror(self.notfounderror.__doc__)

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError:

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Directories to search for the libraries can be specified in the

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting

the BLAS environment variable.

Jak sprawić, żeby to działało?

W mojej odpowiedzi zakładam doświadczenie w Linuksie; Odkryłem, że są trzy warunki wstępne, aby pip install scipydobrze działać.

Idź tutaj: Instalowanie SciPY

Postępuj zgodnie z instrukcjami, aby pobrać, skompilować i wyeksportować zmienną env dla BLAS, a następnie LAPACK . Uważaj, aby nie tylko ślepo wycinać i wklejać polecenia powłoki - będzie kilka linii, które musisz wybrać w zależności od architektury itp., I będziesz musiał naprawić / dodać prawidłowe katalogi, które nieprawidłowo zakłada jako dobrze.

Trzecią rzeczą, której możesz potrzebować, jest zainstalowanie yum numpy-f2py lub odpowiednika.

Och, tak i na koniec, może być konieczne zainstalowanie programu yum gcc-gfortran, ponieważ powyższe biblioteki są źródłami języka Fortran .

To działało dla mnie na Ubuntu 14.04:

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran
pip install scipy

potrzebujesz pakietów deweloperskich libblas i liblapack, jeśli używasz Ubuntu.

aptitude install libblas-dev liblapack-dev
pip install scipy

Ponieważ poprzednie instrukcje instalacji za pomocą yum są zepsute, tutaj zaktualizowane instrukcje instalacji na czymś takim jak fedora. Przetestowałem to na „Amazon Linux AMI 2016.03”

sudo yum install atlas-devel lapack-devel blas-devel libgfortran
pip install scipy

Pracowałem nad projektem, który polegał na numpy i scipy. W czystej instalacji Fedory 23, używając wirtualnego środowiska Pythona dla Pythona 3.4 (działało również dla Pythona 2.7), a także z poniższym w moim setup.py (w setup()metodzie)

setup_requires=[
    'numpy',
],
install_requires=[
    'numpy',
    'scipy',
],

Odkryłem, że muszę wykonać następujące czynności, aby dostać się pip install -e .do pracy:

pip install --upgrade pip

i

sudo dnf install atlas-devel gcc-{c++,gfortran} subversion redhat-rpm-config

redhat-rpm-configJest do stosowania scipy dnia redhat-hardened-cc1, w przeciwieństwie do regularnychcc1

W systemie Windows python 3.5 udało mi się zainstalować scipyza pomocą conda nie pip :

conda install scipy

Co to za system operacyjny? Odpowiedź może zależeć od używanego systemu operacyjnego. Wygląda jednak na to, że musisz znaleźć tę bibliotekę BLAS i zainstalować ją. Wygląda na to, że nie jest w PIP (w związku z tym będziesz musiał to zrobić ręcznie), ale jeśli go zainstalujesz, powinien umożliwić ci postęp w instalacji SciPy.

w moim przypadku aktualizacja pip załatwiła sprawę. Ponadto zainstalowałem scipy z parametrem -U (zaktualizuj wszystkie pakiety do ostatniej dostępnej wersji)