Jak porównać dwa zestawy danych z wykresem QQ za pomocą ggplot2?

11

Jako zarówno statystyki, jak i początkujący R, miałem naprawdę trudny czas, próbując wygenerować qqploty o współczynniku proporcji 1: 1. ggplot2 wydaje się oferować znacznie większą kontrolę nad wykreślaniem niż domyślne pakiety wydruku R, ale nie widzę, jak zrobić qqplot w ggplot2, aby porównać dwa zestawy danych.

Więc moje pytanie, jaki jest odpowiednik ggplot2 czegoś takiego:

qqplot(datset1,dataset2)
psychemedia
źródło
Dokumenty ggplot2 mogą być pomocne: docs.ggplot2.org/current/stat_qq.html
Charlie

Odpowiedzi:

12

Najłatwiej jest po prostu sprawdzić, jak qqplotdziała. Więc w typie R:

R> qqplot
function (x, y, plot.it = TRUE, xlab = deparse(substitute(x)), 
    ylab = deparse(substitute(y)), ...) 
{
    sx <- sort(x)
    sy <- sort(y)
    lenx <- length(sx)
    leny <- length(sy)
    if (leny < lenx) 
        sx <- approx(1L:lenx, sx, n = leny)$y
    if (leny > lenx) 
        sy <- approx(1L:leny, sy, n = lenx)$y
    if (plot.it) 
        plot(sx, sy, xlab = xlab, ylab = ylab, ...)
    invisible(list(x = sx, y = sy))
}
<environment: namespace:stats>

Tak, aby wygenerować wykres Musimy tylko dostać sxi sy, tj:

x <- rnorm(10);y <- rnorm(20)

sx <- sort(x); sy <- sort(y)
lenx <- length(sx)
leny <- length(sy)
if (leny < lenx)sx <- approx(1L:lenx, sx, n = leny)$y
if (leny > lenx)sy <- approx(1L:leny, sy, n = lenx)$y

require(ggplot2)
g = ggplot() + geom_point(aes(x=sx, y=sy))
g

qqplot przy użyciu ggplot2

csgillespie
źródło
2
ggplot2ma stat_qq(), czy jest jakiś sposób, aby tego użyć? Wygląda na to, że zaprojektowano go do porównania jednego wektora z rozkładem teoretycznym, nie mogłem zobaczyć, jak go użyć do porównania dwóch różnych wektorów.
Ken Williams,
7
Możesz qqplot()wykonać wszystkie obliczenia sort/ length/ approxza: d <- as.data.frame(qqplot(x, y, plot.it=FALSE)); ggplot(d) + geom_point(aes(x=x, y=y))
Ken Williams,
9

Używam tego, gdy chcę również normalną linię.

ggplot(data, aes(sample = data$column1)) + stat_qq(color="firebrick2", alpha=1) + geom_abline(intercept = mean(data$column1), slope = sd(data$column1))

KLDavenport
źródło
0

Jeśli twoją pierwotną potrzebą jest jedynie kontrola proporcji, oto jeden ze sposobów, aby to zrobić:

x <- rnorm(1000)
y <- rnorm(1500, 2)

myqq <- function(x, y, ...) {
  rg <- range(x, y, na.rm=T)
  qqplot(x, y, xlim=rg, ylim=rg, ...)
}

myqq(x, y)

fabuła myqq

Ken Williams
źródło