W testowaniu założenia regresji równoległej w regresji logistycznej porządkowej stwierdzam, że istnieje kilka podejść. Użyłem zarówno podejścia graficznego (jak wyszczególniono w książce Harrella), jak i podejścia wyszczególnionego przy użyciu pakietu porządkowego w R.
Chciałbym jednak również uruchomić test Brant (od Staty) zarówno dla poszczególnych zmiennych, jak i dla modelu całkowitego. Rozejrzałem się, ale nie mogę go znaleźć w R.
Czy istnieje implementacja testu Brant w R?
Odpowiedzi:
Zaimplementowałem test brant w R. Pakiet i funkcja nazywa się brant i jest teraz dostępny w CRAN.
Test Branta został zdefiniowany przez Rollina Branta w celu przetestowania założenia regresji równoległej (Brant, R. (1990). Ocena proporcjonalności w modelu proporcjonalnych szans dla porządkowej regresji logistycznej. Biometrics , 46 , 1171–1178).
Oto przykład kodu:
W tym przykładzie obowiązuje regresja równoległa, ponieważ wszystkie wartości p są powyżej 0,05. Omnibus jest przeznaczony dla całego modelu, a reszta dla poszczególnych współczynników.
źródło
Tak - w rzeczywistości pakiet porządkowy, który podłączyłeś, może to zrobić (chociaż nie nazywają go testem Brant). Spójrz na strony 6 i 7 linku, które pokazują „test współczynnika prawdopodobieństwa równych nachyleń lub założenia proporcjonalnych szans”, czyli dokładnie tego, czego szukasz.
źródło
Kilka uwag na ten temat
Pakiet R
VGAM
wCumulative
poleceniu (Regresja porządkowa ze skumulowanymi prawdopodobieństwami) pozwala zmienić założenia proporcjonalności szans, z opcjąparallel=FALSE
.Wiadomo, że jest to częsty problem (z książki: Modele regresji dla zmiennych zależnych kategorycznie przy użyciu Staty, drugie wydanie, J. Scott Long, Jeremy Freese)
Ten artykuł jest dogłębnie poruszony w tym temacie, jest jasny i dobrze napisany, ale nie uwzględnia pakietu VGAM ani polecenia „kumulatywnego”: regresja logistyczna porządkowa w badaniach epidemiologicznych
źródło
Ten samouczek na temat porządkowej regresji logistycznej w R obejmuje testowanie założenia proporcjonalności szans.
źródło