W jednym z moich artykułów wymieniam niektóre wyniki liczbowe oprócz niektórych liczb. Chciałbym się upewnić, że wyniki liczbowe w mojej pracy zawsze zgadzają się z kodem. W tej chwili po prostu kopiuję bezpośrednio wyniki liczbowe z wyników symulacji na papier, co jest niezwykle proste i mało...
Powtarzalność staje się coraz ważniejsza w badaniach w dziedzinie obliczeń. (Na przykład zobacz ten artykuł autorstwa Rogera Penga w nauce ; znam też inne tego rodzaju artykuły i strony internetowe.) Jednak nie jest dla mnie jasne, ile informacji powinienem podać w artykule w czasopiśmie (lub w...
Powtarzalne badania w dziedzinie obliczeń mają na celu udostępnienie kodu potrzebnego do wygenerowania wyników w dokumencie obliczeniowym innym badaczom, aby mogli uruchomić ten kod w celu odtworzenia wyników w tym artykule. Chciałbym, aby wszystkie moje badania były powtarzalne, ale wpadam w...
Równoległa redukcja zakłada, że odpowiednia operacja jest asocjacyjna. Założenie to jest naruszone przy dodawaniu liczb zmiennoprzecinkowych. Możesz zapytać, dlaczego mi na tym zależy. Cóż, sprawia, że wyniki są mniej powtarzalne. I staje się gorzej, gdy symulowane wyżarzanie jest używane do...
Napisałem program / bibliotekę, której użyłem do uzyskania wyników w artykule. (Tutaj jest , ale moje pytanie jest ogólne). Mam testy, które regularnie uruchamiam ctest( uruchomienie zajmuje kilka minut). Aby odtworzyć niektóre tabele lub ryciny w tym artykule, muszę zbudować skrypt lub prosty...
Piszę powtarzalny artykuł, a artykuł ma wyniki obliczeń generowane przez skrypt Pythona (podobny skrypt MATLAB generuje prawie identyczne wyniki). Wydaje mi się, że artykuł byłby łatwiejszy do zrozumienia dla czytelników, gdyby mogli dopasować obliczenia w artykule do obliczeń w kodzie. Praca...
Zwykle piszę kod seryjny, a kiedy to robię, piszę testy jednostkowe za pomocą szkieletu testowego w stylu xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose lub szkielet testowy Google C ++). Na podstawie pobieżnej wyszukiwarki Google nie widziałem wiele na temat tego, jak praktykujący testują kod jednostkowy,...
Fizyka, biologia, chemia itp. Mają różne zestawy zasad przeprowadzania eksperymentów: jakie zdarzenia są uważane za istotne, jak uniknąć zanieczyszczenia próbek, jak stworzyć i naprawić proces reprodukcji i tak dalej. Jakie są standardy, protokoły i najlepsze praktyki zapewniające dokładność i...
Czy istnieje opublikowana lista najlepszych praktyk zapewniających długowieczność kodu, z myślą o odtwarzalnych wynikach naukowych? (np. open source, praktyki dokumentacji, wybór zależności, wybór języka, maszyny wirtualne itp.). Wiedz o wszelkich badaniach (lub ich brak, przykładach /...