Badanie rozwiązywania problemów obliczeniowych poprzez jednoczesne wykorzystanie wielu procesorów.
Rozważam naukę nowego języka do wykorzystania w projektach modelowania numerycznego / symulacyjnego, jako (częściowego) zamiennika dla C ++ i Pythona, którego obecnie używam. Natknąłem się na Julię , co brzmi trochę perfekcyjnie. Jeśli zrobi wszystko, co twierdzi, mógłbym go użyć do zastąpienia...
Obecnie szukam równoległych metod integracji ODE. Istnieje wiele nowej i starej literatury opisującej szeroki wachlarz podejść, ale nie znalazłem żadnych ostatnich badań ani artykułów przeglądowych opisujących ogólnie ten temat. Jest książka Burrage [1], ale ma ona prawie 20 lat i dlatego nie...
Szukam informacji od każdego, kto próbował użyć OpenCL w swoim kodzie naukowym. Czy ktoś próbował (ostatnio) ViennaCL ? Jeśli tak, to jak to się ma do guzka ? Co z OCLTools ? Czy to spełnia obietnicę? Jeśli tak, to czy byłby możliwy sposób na rozpoczęcie pisania jądra matematyki w...
Czy są jakieś narzędzia w Pythonie, które są podobne do parla Matlaba? Znalazłem ten wątek , ale ma on cztery lata. Myślałem, że może ktoś tutaj może mieć nowsze doświadczenia. Oto przykład tego, co chciałbym zrównoważyć: X = np.random.normal(size=(10, 3)) F = np.zeros((10, )) for i in...
To pytanie zostało przeniesione z przepełnienia stosu, ponieważ można na nie odpowiedzieć w programie Computational Science Stack Exchange. Migrował 7 lat temu . Czy są jakieś znane problemy / algorytmy w obliczeniach naukowych, których nie można przyspieszyć przez...
Jak można rozwiązać problem grawitacyjnego n-ciała równolegle numerycznie? Czy możliwy jest kompromis precyzji i złożoności? Jak precyzja wpływa na jakość modelu?
W tej chwili nie uruchamiam żadnego kodu równoległego, ale spodziewam się, że w przyszłości będę używać kodu równoległego, używając hybryd OpenMP i MPI. Debugery były dla mnie nieocenionym narzędziem podczas uruchamiania projektów seryjnych. Czy ktoś może polecić debuger równoległy (lub wiele...
Mam aplikację, która może być trywialnie zrównoleglona, ale jej działanie jest w dużej mierze zależne od operacji we / wy. Aplikacja odczytuje pojedynczą tablicę wejściową przechowywaną w pliku, który zwykle ma rozmiar 2-5 GB (ale spodziewam się, że liczba ta wzrośnie w przyszłości). Typowe...
Chcesz poprawić ten post? Podaj szczegółowe odpowiedzi na to pytanie, w tym cytaty i wyjaśnienie, dlaczego Twoja odpowiedź jest poprawna. Odpowiedzi bez wystarczającej ilości szczegółów mogą być edytowane lub usuwane. Adaptacyjne udoskonalanie siatki (AMR) jest...
Równoległa redukcja zakłada, że odpowiednia operacja jest asocjacyjna. Założenie to jest naruszone przy dodawaniu liczb zmiennoprzecinkowych. Możesz zapytać, dlaczego mi na tym zależy. Cóż, sprawia, że wyniki są mniej powtarzalne. I staje się gorzej, gdy symulowane wyżarzanie jest używane do...
Moja praca dyplomowa dotyczy opracowania numerycznych metod redukcji spalania. Moje metody opieram wyłącznie na chemicznej części symulacji spalania i mam wiele studiów przypadków dotyczących symulacji 0-D (brak przepływu). Chciałbym uruchomić symulacje, które mają w nich przepływ, najlepiej...
Wiele moich własnych prac dotyczy ulepszania skalowania algorytmów, a jednym z preferowanych sposobów wykazania równoległego skalowania i / lub wydajności równoległej jest wykreślenie wydajności algorytmu / kodu na podstawie liczby rdzeni, np. gdzie oś reprezentuje liczbę rdzeni, a oś pewną...
Przepraszam za długi post, ale chciałem załączyć wszystko, co uważałem za istotne za pierwszym razem. Czego chcę Wdrażam równoległą wersję Krystalicznych metod podprzestrzeni dla gęstych matryc. Głównie GMRES, QMR i CG. Zdałem sobie sprawę (po profilowaniu), że moja procedura DGEMV była żałosna....
Prowadzę symulacje dynamiki molekularnej (MD) przy użyciu kilku pakietów oprogramowania, takich jak Gromacs i DL_POLY. Gromacs obsługuje teraz zarówno algorytmy dekompozycji cząstek, jak i dekompozycji domen. Domyślnie symulacje Gromacs wykorzystują rozkład domen, chociaż przez wiele lat, do...
Optymalizuję funkcję 10-20 zmiennych. Zła wiadomość jest taka, że ocena każdej funkcji jest kosztowna, około 30 minut obliczeń szeregowych. Dobrą wiadomością jest to, że mam do dyspozycji klaster z kilkudziesięcioma węzłami obliczeniowymi. Zatem pytanie: czy są dostępne algorytmy optymalizacji,...
W numerycznym rozwiązaniu początkowych wartości granicznych PDE bardzo często stosuje się równoległość w przestrzeni . O wiele rzadziej stosuje się jakąś formę paralelizmu w dyskretyzacji czasu , a paralelizm ten jest zwykle znacznie bardziej ograniczony. Jestem świadomy rosnącej liczby kodów i...
Używam kodu równoległego do numerycznego rozwiązania 5-wymiarowego modelu równowagi populacji. Obecnie mam bardzo dobry kod równoległy MPICH2 w FORTRAN, ale gdy zwiększamy wartości parametrów, tablice stają się zbyt duże, aby działać w trybie pamięci rozproszonej. Mam dostęp do klastra z 15...
Zwykle piszę kod seryjny, a kiedy to robię, piszę testy jednostkowe za pomocą szkieletu testowego w stylu xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose lub szkielet testowy Google C ++). Na podstawie pobieżnej wyszukiwarki Google nie widziałem wiele na temat tego, jak praktykujący testują kod jednostkowy,...
Mam kolekcję modeli obliczeniowych, które można opisać jako asynchroniczne automaty komórkowe. Modele te przypominają model Isinga, ale są nieco bardziej skomplikowane. Wydaje się, że takie modele skorzystałyby na GPU, a nie na CPU. Niestety równoległość takiego modelu nie jest łatwa i wcale nie...
Jak rozumiem, metoda wielosiatkowa rozwiązuje układ liniowy, rozwiązując zgrubną wersję tego samego problemu (tam przez wyeliminowanie błędu niskiej częstotliwości), a następnie rzutując z powrotem na drobną siatkę, aby wygładzić błędy wysokiej częstotliwości. W przypadku dużych systemów widzę, jak...