Moje pochodzenie dotyczy genomiki, ale ostatnio pracuję nad problemami związanymi ze strukturą białek. Napisałem kilka odpowiednich programów w C, budując swój własny parser plików PDB od samego początku. Nie martwiłem się stworzeniem naprawdę solidnego parsera, po prostu wiedziałem, że samodzielne...
Pracuję dość intensywnie w biologii matematycznej / epidemiologii, gdzie większość prac związanych z modelowaniem / naukami obliczeniowymi jest nadal zdominowana przez zestawy ODE, co prawda czasami dość skomplikowane zestawy. Jedną z zalet tych modeli jest to, że można je łatwo opisać i powielić....
Próbowałem stworzyć biologicznie dokładny 2D model przestrzenny warstw tkanek, w których zachodzą różne procesy fizjologiczne. Obejmuje to głównie reakcje chemiczne, dyfuzję i strumienie ponad granicami. Tworzę ten model w COMSOL Multiphysics, pakiecie oprogramowania elementów skończonych, który...
Mam układ zwykłych równań różniczkowych - 7 równań i ~ 30 parametrów rządzących ich zachowaniem w ramach matematycznego modelu przenoszenia choroby. Chciałbym jak znaleźć stabilne stany tych równań Zmiana dx/dt = rest of the equationaby 0 = equationdla każdego z równań sprawia, że prosta algebra...