Pytania oznaczone «c»

Mam kilka trudnych, niewypukłych problemów globalnej optymalizacji do rozwiązania. Obecnie używam MATLAB's Optimization Toolbox (konkretnie fmincon()z algorytmem = 'sqp'), co jest dość skuteczne . Jednak większość mojego kodu znajduje się w języku Python i chciałbym również przeprowadzić...

To pytanie jest rozszerzeniem dwóch dyskusji, które pojawiły się ostatnio w odpowiedziach na „ C ++ vs Fortran for HPC ”. I jest to trochę więcej wyzwanie niż pytanie ... Jednym z najczęściej słyszanych argumentów na korzyść Fortrana jest to, że kompilatory są po prostu lepsze. Ponieważ większość...

W moim programie doktoranckim z zakresu obliczeń pracujemy prawie wyłącznie w C ++ i Fortran. Wygląda na to, że niektórzy profesorowie wolą jeden od drugiego. Zastanawiam się, który z nich jest „lepszy” lub czy w pewnych okolicznościach jest lepszy od

Wiele algorytmów numerycznych (integracja, różnicowanie, interpolacja, funkcje specjalne itp.) Jest dostępnych w bibliotekach obliczeń naukowych, takich jak GSL . Ale często widzę kod z „ręcznie walcowanymi” implementacjami tych funkcji. Czy w przypadku małych programów, które niekoniecznie są...

Ostatnio spotkałem się z przypadkiem, w którym potrzebowałem operacji dzielenia liczb całkowitych na chipie, który jej nie miał (ARM Cortex-A8). Próbując zbadać, dlaczego tak musi być, odkryłem, że ogólny podział zajmuje znacznie więcej cykli niż dodawanie, odejmowanie lub mnożenie na prawie...

Czy dobrym pomysłem jest użycie vector<vector<double>>(przy użyciu std) do utworzenia klasy macierzy dla wysokowydajnego naukowego kodu komputerowego? Jeśli odpowiedź brzmi „nie”. Czemu?

Z ankiety przeprowadzonej wśród top500 wynika, że ​​przemysł zmierza w kierunku wykładniczego wzrostu liczby rdzeni przetwarzających . Największe superkomputery wykorzystują MPI do komunikacji między węzłami, chociaż nie wydaje się, aby istniał wyraźny trend równoległości w węzłach, przy...

Jak CUDA i OpenCL porównują się ze sobą pod koniec 2013 roku z perspektywy programisty? Moja grupa myśli o próbie wykorzystania obliczeń na GPU. Czy ograniczalibyśmy się znacznie, wybierając sprzęt obsługujący tylko OpenCL, ale nie CUDA? Aby być bardziej szczegółowym, czy poniższe założenia są...

Co może pójść nie tak, gdy zastosuje się wstępne metody Kryłowa z KSP ( pakiet solvera liniowego PETSc ) do rozwiązania rzadkiego układu liniowego, takiego jak te uzyskane przez dyskretyzację i linearyzację równań różniczkowych cząstkowych? Jakie kroki mogę podjąć, aby ustalić, co jest nie tak z...

O ile mogę stwierdzić, dwie duże ogólne ramy oprogramowania do obliczeń informatycznych Departamentu Energii w USA to PETSc i Trilinos . Na pierwszy rzut oka wydają się podobne, poza różnicami językowymi (C kontra C ++). Jakie są główne różnice między tymi dwoma ramami i jakie czynniki powinny...

Załóżmy, że pracuję nad kodem naukowym w C ++. W niedawnej dyskusji z kolegą argumentowano, że szablony wyrażeń mogą być bardzo złe, potencjalnie czyniąc oprogramowanie kompilowalnym tylko w niektórych wersjach gcc. Podobno problem ten wpłynął na kilka kodów naukowych, jak wspomniano w podtytułach...

Amazon EC2 Compute Cluster kosztuje około $ 800- $ 1000 (w zależności od cyklu pracy) na rdzeń procesora fizycznego ciągu 3 lat. Podczas naszej ostatniej rundy akwizycji sprzętu moje laboratorium wybrało sprzęt o wartości 48 rdzeni bardzo podobny do klastrów Amazon za około ~ 300 USD za rdzeń. Czy...

Używam nieliniowego pakietu solvera PETSc SNES do rozwiązania układu równań nieliniowych uzyskanych przez dyskretyzację równania różniczkowego cząstkowego. Jak mogę ustalić, dlaczego solver nie jest zbieżny i co mogę zrobić, aby pomyślnie rozwiązać moje

Paradygmat programowania OpenCL zapowiada się jako darmowy, otwarty standard dla heterogenicznych obliczeń. Czy powinniśmy poświęcać czas na tworzenie oprogramowania opartego na OpenCL? Za I

Zacznę od mojego osobistego doświadczenia w naszym laboratorium. W ciągu 9 i 10 dni w ifort byliśmy dość agresywni w zakresie optymalizacji, kompilując z flagami -O3 i specyficznymi dla procesora (na przykład -xW -xSSE4.2). Ale zaczynając od ifort 11, zaczęliśmy zauważać: 1. pewne niespójności w...

Chcę opracować od podstaw równoległe oprogramowanie do obliczeń naukowych. Chcę się zastanowić, od którego języka zacząć. Program obejmuje odczytywanie / zapisywanie danych do plików txt i wykonywanie ciężkich obliczeń równolegle, z wieloma faktoryzacjami LU i wykorzystaniem rzadkich liniowych...

Chciałbym wiedzieć, czy istnieje szybki sposób na obliczenie odległości euklidesowej dwóch wektorów w oktawie. Wydaje się, że nie ma do tego żadnej specjalnej funkcji, więc czy powinienem po prostu użyć formuły z

Wiele moich własnych prac dotyczy ulepszania skalowania algorytmów, a jednym z preferowanych sposobów wykazania równoległego skalowania i / lub wydajności równoległej jest wykreślenie wydajności algorytmu / kodu na podstawie liczby rdzeni, np. gdzie oś reprezentuje liczbę rdzeni, a oś pewną...

Moje pochodzenie dotyczy genomiki, ale ostatnio pracuję nad problemami związanymi ze strukturą białek. Napisałem kilka odpowiednich programów w C, budując swój własny parser plików PDB od samego początku. Nie martwiłem się stworzeniem naprawdę solidnego parsera, po prostu wiedziałem, że samodzielne...

Nasza grupa robocza tworzy aplikację komputerową, która symuluje wydajność energetyczną budynku. Jest to aplikacja .NET, a gdy użytkownik uruchamia wiele symulacji, może to zająć dużo czasu. Symulacje są w pełni zrównoleglalne, a my mamy bardzo znaczące zasoby obliczeniowe HPC w „biurze”. Jednym z...