Dział chemii zajmujący się wykorzystaniem modeli matematycznych do rozwiązywania problemów chemicznych.
Ostatnio spotkałem się z sformułowaniem meta-zjawiska : „ dwa są łatwe, trzy są trudne ” (sformułowane w ten sposób przez Federico Poloni), które można opisać następująco: Kiedy sformułowany jest pewien problem dla dwóch podmiotów, jest on stosunkowo łatwy do rozwiązania; jednak algorytm...
W końcu udało ci się dowiedzieć, w jaki sposób atomy są rozmieszczone przestrzennie na nowo odkrytej istocie molekularnej. Za pomocą, powiedzmy, metod spektroskopowych, jesteś teraz w posiadaniu szeregu współrzędnych atomu, typów atomów, długości wiązań, typów wiązań i innych elementów cząsteczki....
Czytałem o naukach obliczeniowych na Wikipedii, ale moje rozumienie nie jest zbyt jasne. Czy nauka obliczeniowa wymaga programowania? Czym różni się nauka obliczeniowa od obliczeniowej _ ____ , gdzie ślepą próbą może być dowolna dyscyplina (materiałoznawstwo, inżynieria, chemia, biologia itd.)?...
Czym dokładnie jest korekta przeciwdziałania? Czy możesz wyjaśnić, kiedy jest to potrzebne i
W szczególności chcę przedłużyć pracę z B3LYP rozpoczętą od Gaussian 03, ale kontynuowałem w GAMESS-US. Energie dostarczane przez domyślne metody B3LYP nie są takie same. Dyskusja na ten temat znajduje się w podręczniku GAMESS-US (sekcja Dalsze informacje): Należy zauważyć, że B3LYP w GAMESS...
Czy istnieją przypadki, w których Hartree-Fock nie jest dobrym przybliżeniem do obliczenia geometrii równowagi, gdy cząsteczka nie jest w stanie zerwania wiązania?
Czy istnieje algorytm, który wylicza wykresy odpowiadające pewnej teselacji punktów Delaunaya w 3D? Jeśli tak, to czy istnieje wydajna parametryzacja geometrii, która odpowiada dowolnemu „grafowi Delaunaya”? Staram się wyliczyć systematycznie wszystkie stabilne geometrie cząsteczek o określonym...
Białka są zwykle przedstawiane w formie kreskówek, z arkuszami β jako strzałkami i helisami α jako cewki: Zastanawiam się, czy jest jakieś odniesienie, które opisuje budowę tej reprezentacji? To znaczy, jakie obiekty matematyczne są używane do budowy tych grafik i na jakich atomach / kierunkach...
Jestem nowy w programowaniu i próbuję rozwiązać swój pierwszy duży problem i napisać swój pierwszy duży program. Szukałem przykładów kodu open source do nauki, ale jak dotąd znalazłem tylko kod w językach, których nie do końca rozumiem lub które zawierają pokrewne, ale wciąż zbyt odległe rzeczy,...
Chciałbym wizualizować wibrację molekularną, która nie jest normalnym trybem. Chciałbym przedstawić statyczną, wektorową reprezentację ruchu i chciałbym mieć pewną elastyczność w stylu wektorowym (rozmiar, kolor itp.). Interesuje mnie również nagrywanie wibracji. Jakie są dobre zasoby do...
Obecnie produkuję obrazy 1d i 2d za pomocą Matlaba w celu porównania dokładności z danym modelem. Muszę porównać moje metody ze standardowym modelem Gaussa .wfn i zamierzam to zrobić, analizując gęstość cząsteczki, a także laplaciana. Interesuje mnie tworzenie obrazów 2D różnic w przybliżeniu do...
Mówi się, że niektóre zestawy bazowe są „zgodne z korelacją”. Co to znaczy w
W metodzie samodzielnego pola Hartree-Focka rozwiązywania niezależnego od czasu elektronicznego równania Schroedingera dążymy do zminimalizowania energii stanu podstawowego, , układu elektronów w polu zewnętrznym w odniesieniu do wyboru orbitali spinowych, { χ i }