Używam modelu mieszanego w R( lme4) do analizy niektórych danych z powtarzanymi pomiarami. Mam zmienną odpowiedzi (zawartość włókna w kale) i 3 stałe efekty (masa ciała itp.). Moje badanie ma tylko 6 uczestników, z 16 powtarzanymi pomiarami dla każdego z nich (chociaż dwóch ma tylko 12 powtórzeń)....
Założeniem jest ten cytat z winiety z pakietu R betareg1 . Co więcej, model ma pewne właściwości (takie jak predyktor liniowy, funkcja łącza, parametr dyspersji) z uogólnionymi modelami liniowymi (GLM; McCullagh i Nelder 1989), ale nie jest to szczególny przypadek tego szkieletu (nawet dla...
Mam pytanie dotyczące ujemnej regresji dwumianowej: Załóżmy, że masz następujące polecenia: require(MASS) attach(cars) mod.NB<-glm.nb(dist~speed) summary(mod.NB) detach(cars) (Pamiętaj, że samochody to zestaw danych, który jest dostępny w R, i tak naprawdę nie obchodzi mnie, czy ten model ma...
W Internecie wiele znalazłem na temat interpretacji efektów losowych i stałych. Jednak nie udało mi się uzyskać źródła określającego: Jaka jest matematyczna różnica między efektami losowymi i stałymi? Rozumiem przez to matematyczne sformułowanie modelu i sposób szacowania...
Mam macierz korelacji zwrotów bezpieczeństwa, których wyznacznikiem jest zero. (Jest to nieco zaskakujące, ponieważ macierz korelacji próbki i odpowiadająca jej macierz kowariancji powinny teoretycznie być określone dodatnio). Moja hipoteza jest taka, że co najmniej jedno zabezpieczenie jest...
Mam następujące dane wyjściowe: Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation Formula: aph.remain ~ sMFS2 +sAG2 +sSHDI2 +sbare +season +crop +(1|landscape) AIC BIC logLik deviance 4062 4093 -2022 4044 Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. landscape (Intercept)...
Cytat blokowy poniżej, od liderów w dziedzinie modelowania efektów mieszanych, twierdzi, że koordynacja przesunięć w modelach z zerową korelacją między efektami losowymi (modele „ZCP”) zmienia prognozy modeli. Ale czy ktoś może rozwinąć lub uzasadnić swoje roszczenia? Sprawozdania te zostały...
Przeprowadziłem powtarzający się projekt, w którym przetestowałem 30 mężczyzn i 30 kobiet w trzech różnych zadaniach. Chcę zrozumieć, jak różni się zachowanie mężczyzn i kobiet i jak to zależy od zadania. Użyłem zarówno pakietu lmer, jak i lme4, aby to zbadać, jednak utknąłem przy próbie...
To jest mój pierwszy post, więc uspokój się, jeśli nie przestrzegam niektórych standardów! Poszukałem pytania i nic nie wyszło. Moje pytanie dotyczy głównie praktycznych różnic między ogólnym modelowaniem liniowym (GLM) a uogólnionym modelowaniem liniowym (GZLM). W moim przypadku byłoby to kilka...
Próbuję dopasować dane do GLM (regresja Poissona) w R. Kiedy wykreśliłem reszty w stosunku do dopasowanych wartości, wykres utworzył wiele (prawie liniowych z lekką wklęsłą krzywą) „linii”. Co to znaczy? library(faraway) modl <- glm(doctorco ~ sex + age + agesq + income + levyplus + freepoor +...
lmerTestPakiet zawiera anova()funkcję liniowe modele mieszane z ewentualnie zbliżenia Satterthwaite'a (domyślnie) Kenward-Roger ze stopniami swobody (df). Jaka jest różnica między tymi dwoma podejściami? Kiedy wybrać,
Obecnie mam trudności ze znalezieniem odpowiedniego modelu dla danych trudnych do zliczenia (zmienna zależna). Próbowałem różnych modeli (modele efektów mieszanych są niezbędne dla mojego rodzaju danych), takich jak lmeri lme4(z transformacją logarytmiczną), a także uogólnionych liniowych modeli...
Zamknięte. To pytanie jest nie na temat . Obecnie nie przyjmuje odpowiedzi. Chcesz poprawić to pytanie? Zaktualizuj pytanie, aby było tematem dotyczącym weryfikacji krzyżowej. Zamknięte 6 miesięcy temu . Pracowałem w pakietach R nlme i lme4 , próbując...
Oto kilka informacji na temat mojej sytuacji: moje dane odnoszą się do liczby ofiar, które z powodzeniem zjadły drapieżniki. Ponieważ liczba ofiar jest ograniczona (25 dostępnych) w każdej próbie, miałem kolumnę „Próbka” reprezentującą liczbę dostępnej ofiary (czyli 25 w każdej próbie), a drugą o...
Obecnie korzystam z modeli liniowych z mieszanym efektem. Korzystam z pakietu „lme4” w języku R. Moje modele mają postać: model <- lmer(response ~ predictor1 + predictor2 + (1 | random effect)) Przed uruchomieniem moich modeli sprawdziłem możliwą wielokoliniowość między...
Zastanawiam się, czy istnieje jakiś algorytm, który mógłby dokonać klasyfikacji i regresji w tym samym czasie. Na przykład chciałbym, aby algorytm nauczył się klasyfikatora, a jednocześnie w ramach każdej etykiety uczy się również ciągłego celu. Zatem dla każdego przykładu szkolenia ma kategoryczną...
Załóżmy, że model ma 100% dokładności danych treningowych, ale 70% dokładności danych testowych. Czy następujący argument dotyczy tego modelu? Oczywiste jest, że jest to model przebudowany. Dokładność testu można zwiększyć, zmniejszając nadmierne dopasowanie. Ale ten model może nadal być...
Mam problem z uznaniem korzyści oznaczania czynnika modelowego za losowy z kilku powodów. Wydaje mi się, że prawie we wszystkich przypadkach optymalnym rozwiązaniem jest traktowanie wszystkich czynników jako ustalonych. Po pierwsze, rozróżnienie między ustalonym a losowym jest dość arbitralne....
Próbuję przejść z używania ezpakietu do lmeANOVA dla powtarzanych pomiarów (ponieważ mam nadzieję, że będę w stanie używać niestandardowych kontrastów lme). Zgodnie z radą z tego wpisu na blogu udało mi się skonfigurować ten sam model, używając zarówno aov(jak to się dzieje ez, kiedy jest to...
Jestem trochę zdezorientowany co do zalet mieszanych modeli w zakresie modelowania predykcyjnego. Ponieważ modele predykcyjne mają zwykle przewidywać wartości wcześniej nieznanych obserwacji, wydaje mi się oczywiste, że jedynym sposobem, w jaki model mieszany może być użyteczny, jest jego zdolność...