Chcę przeglądać plik .rda (zestaw danych R). Wiem o View(datasetname)poleceniu. Domyślna R.app dostarczana na komputery Mac nie ma bardzo dobrej przeglądarki danych (otwiera okno w X11). Podoba mi się przeglądarka danych RStudio, która otwiera się za pomocą Viewpolecenia. Wyświetla jednak tylko...
To pytanie ma już odpowiedź tutaj: Czym dokładnie jest ziarno w generatorze liczb losowych? 3 odpowiedzi Zdaję sobie sprawę, że używa się set.seed()w R do generowania liczb pseudolosowych. Zdaję sobie również sprawę z tego, że używając tego samego numeru, np....
Wiem, że jest to dość specyficzne Rpytanie, ale mogę myśleć o wariancji proporcji wyjaśnionej, , niepoprawnie. Tutaj idzie.R2R2R^2 Próbuję użyć Rpakietu randomForest. Mam trochę danych treningowych i danych testowych. Po dopasowaniu losowego modelu lasu randomForestfunkcja umożliwia wprowadzenie...
Mam zestaw danych szeregów czasowych. Każda seria obejmuje ten sam okres, chociaż rzeczywiste daty w każdej serii czasowej mogą nie być dokładnie w jednej linii. To znaczy, jeśli szeregi czasowe miałyby zostać odczytane w matrycy 2D, wyglądałoby to tak: date T1 T2 T3 .... TN 1/1/01 100 59 42...
W dokumentach klasyfikacyjnych ImageNet wskaźniki błędu 1 i 5 są ważnymi jednostkami do pomiaru sukcesu niektórych rozwiązań, ale jakie są te poziomy błędów? W ImageNet Classification with Deep Convolutional Neural Networks autorstwa Krizhevsky i in. każde rozwiązanie oparte na jednym CNN (strona...
Wielokrotnie oczywiste jest, dlaczego preferuje się obiektywny estymator. Ale czy są jakieś okoliczności, w których moglibyśmy faktycznie preferować stronniczy estymator od
Jestem całkiem nowy z dwumianowymi testami danych, ale musiałem to zrobić, a teraz nie jestem pewien, jak interpretować wynik. Zmienna y, zmienna odpowiedzi, jest dwumianowa, a czynniki objaśniające są ciągłe. Oto co otrzymałem podsumowując wynik: glm(formula = leaves.presence ~ Area, family =...
Szukam artykułu, który mógłby pomóc w wytyczeniu sposobu wyboru hiperparametrów głębokiej architektury, takich jak piętrowe auto-kodery lub sieci głęboko wierzące. Istnieje wiele hiperparametrów i jestem bardzo zdezorientowany, jak je wybrać. Również stosowanie weryfikacji krzyżowej nie jest opcją,...
Obecnie używam pakietu R. lme4 . Używam liniowych modeli efektów mieszanych z efektami losowymi: library(lme4) mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect + # random effects mod3 <-...
Test Mantela jest szeroko stosowany w badaniach biologicznych w celu zbadania korelacji między rozkładem przestrzennym zwierząt (pozycja w przestrzeni) z, na przykład, ich genetycznym spokrewnieniem, szybkością agresji lub innymi atrybutami. Korzysta z niego wiele dobrych czasopism ( PNAS, Animal...
Widzę, że istnieje wiele formalnych różnic między miarami odległości Kullback – Leibler vs. Kołmogorow-Smirnov. Oba są jednak używane do pomiaru odległości między rozkładami. Czy istnieje typowa sytuacja, w której należy użyć jednej zamiast drugiej? Jakie jest uzasadnienie...
Chcę założyć, że temperatura powierzchni morza w Morzu Bałtyckim jest taka sama rok po roku, a następnie opisać to za pomocą modelu funkcyjnego / liniowego. Pomysł, jaki miałem, to po prostu wpisać rok jako liczbę dziesiętną (lub num_months / 12) i ustalić, jaka powinna być temperatura w tym...
Chcę uzyskać przedział przewidywania wokół prognozy z modelu lmer (). Znalazłem trochę dyskusji na ten temat: http://rstudio-pubs-static.s3.amazonaws.com/24365_2803ab8299934e888a60e7b16113f619.html http://glmm.wikidot.com/faq ale wydaje się, że nie uwzględniają niepewności losowych efektów. Oto...
Zbudowałem regresję logistyczną, w której zmienna wynikowa jest leczona po otrzymaniu leczenia ( Curevs. No Cure). Wszyscy pacjenci w tym badaniu zostali poddani leczeniu. Interesuje mnie, czy cukrzyca jest związana z tym wynikiem. W R mój wynik regresji logistycznej wygląda następująco:...
Wyprowadzanie liczbowe MLE z GLMM jest trudne i, w praktyce, wiem, nie powinniśmy stosować optymalizacji siły brutalnej (np. Używając optimw prosty sposób). Ale dla własnego celu edukacyjnego chcę go wypróbować, aby upewnić się, że poprawnie rozumiem model (patrz poniższy kod). Odkryłem, że zawsze...
Korzystałem z pakietu Caret w R do budowania modeli predykcyjnych do klasyfikacji i regresji. Caret zapewnia zunifikowany interfejs do dostrajania hiperparametrów modelu poprzez weryfikację krzyżową lub wiązanie rozruchu. Na przykład, jeśli budujesz prosty model „najbliższych sąsiadów” do celów...
Przeprowadziłem analizę składowych głównych (PCA) z R przy użyciu dwóch różnych funkcji ( prcompi princomp) i zauważyłem, że wyniki PCA różnią się znakiem. Jak to możliwe? Rozważ to: set.seed(999) prcomp(data.frame(1:10,rnorm(10)))$x PC1 PC2 [1,] -4.508620 -0.2567655 [2,] -3.373772...
Mam 2 proste pytania dotyczące regresji liniowej: Kiedy zaleca się ujednolicenie zmiennych objaśniających? Po przeprowadzeniu oszacowania ze znormalizowanymi wartościami, jak można przewidzieć nowe wartości (jak należy znormalizować nowe wartości)? Niektóre referencje byłyby pomocne....
Starałam się dopasować swoje dane w różnych modelach i zorientowali się, że fitdistrfunkcja z biblioteki MASSz Rdaje mi Negative Binomialjak najlepszego dopasowania. Teraz ze strony wiki definicja jest podana jako: Rozkład NegBin (r, p) opisuje prawdopodobieństwo k awarii i r sukcesów w próbach...
Chciałbym zmierzyć czas potrzebny do powtórzenia działania funkcji. Czy replicate()używanie pętli for jest równoważne? Na przykład: system.time(replicate(1000, f())); system.time(for(i in 1:1000){f()}); Która jest preferowaną metodą. Na wyjściu system.time(), to sys+userrzeczywisty czas CPU na...