Cytat blokowy poniżej, od liderów w dziedzinie modelowania efektów mieszanych, twierdzi, że koordynacja przesunięć w modelach z zerową korelacją między efektami losowymi (modele „ZCP”) zmienia prognozy modeli. Ale czy ktoś może rozwinąć lub uzasadnić swoje roszczenia? Sprawozdania te zostały...
lmerTestPakiet zawiera anova()funkcję liniowe modele mieszane z ewentualnie zbliżenia Satterthwaite'a (domyślnie) Kenward-Roger ze stopniami swobody (df). Jaka jest różnica między tymi dwoma podejściami? Kiedy wybrać,
Mam problem z uznaniem korzyści oznaczania czynnika modelowego za losowy z kilku powodów. Wydaje mi się, że prawie we wszystkich przypadkach optymalnym rozwiązaniem jest traktowanie wszystkich czynników jako ustalonych. Po pierwsze, rozróżnienie między ustalonym a losowym jest dość arbitralne....
Jestem trochę zdezorientowany co do zalet mieszanych modeli w zakresie modelowania predykcyjnego. Ponieważ modele predykcyjne mają zwykle przewidywać wartości wcześniej nieznanych obserwacji, wydaje mi się oczywiste, że jedynym sposobem, w jaki model mieszany może być użyteczny, jest jego zdolność...
Próbuję przejść z używania ezpakietu do lmeANOVA dla powtarzanych pomiarów (ponieważ mam nadzieję, że będę w stanie używać niestandardowych kontrastów lme). Zgodnie z radą z tego wpisu na blogu udało mi się skonfigurować ten sam model, używając zarówno aov(jak to się dzieje ez, kiedy jest to...
I zostały pominie ten przegląd lm / lmer formuł R od @conjugateprior i irytować się według następującego wpisu: Załóżmy teraz, że A jest losowy, ale B jest stały, a B jest zagnieżdżony w A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) Poniżej przedstawiono analogiczną formułę modelu mieszanego lmer(Y ~ B...
Zastanawiam się, czy istnieją metody obliczania wielkości próby w modelach mieszanych? Używam lmerw R, aby dopasować modele (mam losowe zbocza i
Przeprowadziliśmy regresję logistyczną efektów mieszanych przy użyciu następującej składni; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Przedmiot i przedmiot to efekty losowe. Otrzymujemy...
Jak zwykle porównywane są (liniowe) modele efektów mieszanych? Wiem, że można zastosować testy współczynnika prawdopodobieństwa, ale to nie działa, jeśli jeden model nie jest „podzbiorem” drugiego, prawda? Czy oszacowanie modeli df jest zawsze proste? Szacowana liczba stałych efektów + liczba...
Niedawno przystąpiłem do dopasowywania modeli mieszanych z regresją w ramach Bayesa, używając algorytmu MCMC (właściwie funkcja MCMCglmm w R). Wydaje mi się, że zrozumiałem, jak zdiagnozować zbieżność procesu szacowania (ślad, wykres Geweke'a, autokorelacja, rozkład tylny ...). Jedną z rzeczy,...
Uruchomiłem uogólniony liniowy model mieszany w R i uwzględniłem efekt interakcji między dwoma predyktorami. Interakcja nie była znacząca, ale główne efekty (dwa predyktory) były oba. Teraz wiele przykładów z podręczników mówi mi, że jeśli istnieje znaczący efekt interakcji, głównych efektów nie...
Na konferencji usłyszałem następujące oświadczenie: 100 pomiarów dla 5 osób dostarcza znacznie mniej informacji niż 5 pomiarów dla 100 osób. To trochę oczywiste, że to prawda, ale zastanawiałem się, jak można to udowodnić matematycznie ... Myślę, że można zastosować liniowy model mieszany....
Mam eksperyment z powtarzanymi pomiarami, w którym zmienna zależna jest procentem, i mam wiele czynników jako zmienne niezależne. Chciałbym użyć glmerpakietu R, lme4aby potraktować go jako problem z regresją logistyczną (poprzez określenie family=binomial), ponieważ wydaje się, że bezpośrednio...
Za pomocą następującego zestawu danych chciałem sprawdzić, czy odpowiedź (efekt) zmienia się w odniesieniu do witryn, sezonu, czasu trwania i ich interakcji. Niektóre internetowe fora poświęcone statystykom sugerowały, żebym kontynuował liniowe modele z efektami mieszanymi, ale problem polega na...
Po przeprowadzeniu analizy głównego składnika (PCA) chcę rzutować nowy wektor na przestrzeń PCA (tzn. Znaleźć jego współrzędne w układzie współrzędnych PCA). Mam obliczony PCA w języku R użyciu prcomp. Teraz powinienem być w stanie pomnożyć mój wektor przez macierz obrotu PCA. Czy główne elementy...
Użyłem wielokrotnej imputacji, aby uzyskać liczbę kompletnych zestawów danych. Użyłem metod bayesowskich na każdym z kompletnych zestawów danych, aby uzyskać rozkłady tylne dla parametru (efekt losowy). Jak mogę połączyć / połączyć wyniki dla tego parametru? Więcej kontekstu: Mój model jest...
Precyzja jest zdefiniowana jako: p = true positives / (true positives + false positives) Czy jest to prawidłowe, że, jak true positivesi false positivespodejście 0, precyzja zbliża 1? To samo pytanie do przypomnienia: r = true positives / (true positives + false negatives) Obecnie wdrażam...
Wiemy, że sparowany test t jest tylko specjalnym przypadkiem jednokierunkowej ANOVA z powtarzanymi pomiarami (lub wewnątrz podmiotu), a także liniowym modelem mieszanego efektu, który można zademonstrować za pomocą funkcji lme () pakiet nlme w języku R jak pokazano niżej. #response data from 10...
Współpracownik analizuje niektóre dane biologiczne pod kątem swojej pracy doktorskiej z pewną nieprzyjemną heteroscedastycznością (rysunek poniżej). Analizuje to za pomocą modelu mieszanego, ale nadal ma problemy z resztkami. Logarytmiczne przekształcanie zmiennych odpowiedzi czyści wszystko i na...
Patrzyłem na modelowanie efektów mieszanych przy użyciu pakietu lme4 w R. Używam głównie lmerpolecenia, więc zadam pytanie poprzez kod, który używa tej składni. Przypuszczam, że ogólne łatwe pytanie może być takie: czy można porównywać dowolne dwa modele zbudowane przy lmerużyciu współczynników...